Extensive loss of translational genes in the structurally dynamic mitochondrial genome of the angiosperm Silene latifolia
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F10%3A00350206" target="_blank" >RIV/61389030:_____/10:00350206 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Extensive loss of translational genes in the structurally dynamic mitochondrial genome of the angiosperm Silene latifolia
Popis výsledku v původním jazyce
In this study, we report the first complete mitochondrial genome sequence from a member of this family, Silene latifolia. The genome can be mapped as a 253,413 bp circle, but its structure is complicated by a large repeated region that is present in 6 copies. Active recombination among these copies produces a suite of alternative genome configurations that appear to be at or near ?recombinational equilibrium. The genome contains the fewest genes of any angiosperm mitochondrial genome sequenced to date,with intact copies of only 25 of the 41 protein genes inferred to be present in the common ancestor of all angiosperms. Ribosomal proteins have been especially prone to gene loss in the S. latifolia lineage. The genome has also experienced a major reduction in tRNA gene content, including loss of functional tRNAs of both native and chloroplast origin. In addition, genes encoding 18S and, especially, 5S rRNA exhibit exceptional divergence relative to other plants.
Název v anglickém jazyce
Extensive loss of translational genes in the structurally dynamic mitochondrial genome of the angiosperm Silene latifolia
Popis výsledku anglicky
In this study, we report the first complete mitochondrial genome sequence from a member of this family, Silene latifolia. The genome can be mapped as a 253,413 bp circle, but its structure is complicated by a large repeated region that is present in 6 copies. Active recombination among these copies produces a suite of alternative genome configurations that appear to be at or near ?recombinational equilibrium. The genome contains the fewest genes of any angiosperm mitochondrial genome sequenced to date,with intact copies of only 25 of the 41 protein genes inferred to be present in the common ancestor of all angiosperms. Ribosomal proteins have been especially prone to gene loss in the S. latifolia lineage. The genome has also experienced a major reduction in tRNA gene content, including loss of functional tRNAs of both native and chloroplast origin. In addition, genes encoding 18S and, especially, 5S rRNA exhibit exceptional divergence relative to other plants.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
BMC Evolutionary Biology
ISSN
1471-2148
e-ISSN
—
Svazek periodika
10
Číslo periodika v rámci svazku
274
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
15
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000282769300001
EID výsledku v databázi Scopus
—