Gene Networks and Chromatin and Transcriptional Regulation of the Phaseolin Promoter in Arabidopsis
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F13%3A00399321" target="_blank" >RIV/61389030:_____/13:00399321 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1105/tpc.113.112714" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1105/tpc.113.112714</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1105/tpc.113.112714" target="_blank" >10.1105/tpc.113.112714</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Gene Networks and Chromatin and Transcriptional Regulation of the Phaseolin Promoter in Arabidopsis
Popis výsledku v původním jazyce
The complete lack of seed storage protein expression in vegetative tissues and robust expression during embryogenesis makes seed development an ideal system to study tissue-specific expression of genes. The promoter for the Phaseolin (phas) gene, which encodes the major seed storage protein in bean (Phaseolus vulgaris), is activated in two sequential steps: Phaseolus vulgaris ABI3-like factor (Pv-ALF)-dependent potentiation and abscisic acid-mediated activation. In this study, a heterologous in vivo Pv-ALF/phas-GUS (for beta-glucuronidase) expression system in transgenic Arabidopsis thaliana leaves was used in conjunction with the powerful RNA-Seq approach to capture transcriptional landscapes of phas promoter expression. Remarkably, expression of over1300 genes from 11 functional categories coincided with changes in the transcriptional status of the phas promoter. Gene network analysis of induced genes and artificial microRNA-mediated loss-of-function genetic assays identified transc
Název v anglickém jazyce
Gene Networks and Chromatin and Transcriptional Regulation of the Phaseolin Promoter in Arabidopsis
Popis výsledku anglicky
The complete lack of seed storage protein expression in vegetative tissues and robust expression during embryogenesis makes seed development an ideal system to study tissue-specific expression of genes. The promoter for the Phaseolin (phas) gene, which encodes the major seed storage protein in bean (Phaseolus vulgaris), is activated in two sequential steps: Phaseolus vulgaris ABI3-like factor (Pv-ALF)-dependent potentiation and abscisic acid-mediated activation. In this study, a heterologous in vivo Pv-ALF/phas-GUS (for beta-glucuronidase) expression system in transgenic Arabidopsis thaliana leaves was used in conjunction with the powerful RNA-Seq approach to capture transcriptional landscapes of phas promoter expression. Remarkably, expression of over1300 genes from 11 functional categories coincided with changes in the transcriptional status of the phas promoter. Gene network analysis of induced genes and artificial microRNA-mediated loss-of-function genetic assays identified transc
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/ME10038" target="_blank" >ME10038: Regulace transkripce faseolinu na úrovni chromatinu</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plant Cell
ISSN
1040-4651
e-ISSN
—
Svazek periodika
25
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
17
Strana od-do
2601-2617
Kód UT WoS článku
000323650900019
EID výsledku v databázi Scopus
—