Extensive Pericentric Rearrangements in the Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Genotype "Chinese Spring" Revealed from Chromosome Shotgun Sequence Data
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F14%3A00441331" target="_blank" >RIV/61389030:_____/14:00441331 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evu237" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evu237</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evu237" target="_blank" >10.1093/gbe/evu237</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Extensive Pericentric Rearrangements in the Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Genotype "Chinese Spring" Revealed from Chromosome Shotgun Sequence Data
Popis výsledku v původním jazyce
The bread wheat (Triticum aestivum L.) genotype "Chinese Spring" ("CS") is the reference base in wheat genetics and genomics. Pericentric rearrangements in this genotype were systematically assessed by analyzing homoeoloci for a set of nonredundant genesfrom Brachypodium distachyon, Triticum urartu, and Aegilops tauschii in the CS chromosome shotgun sequence obtained from individual chromosome arms flow-sorted from CS aneuploid lines. Based on patterns of their homoeologous arm locations, 551 genes indicated the presence of pericentric inversions in at least 10 of the 21 chromosomes. Available data from deletion bin-mapped expressed sequence tags and genetic mapping in wheat indicated that all inversions had breakpoints in the low-recombinant gene-poor pericentromeric regions. The large number of putative intrachromosomal rearrangements suggests the presence of extensive structural differences among the three subgenomes, at least some of which likely occurred during the production of
Název v anglickém jazyce
Extensive Pericentric Rearrangements in the Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Genotype "Chinese Spring" Revealed from Chromosome Shotgun Sequence Data
Popis výsledku anglicky
The bread wheat (Triticum aestivum L.) genotype "Chinese Spring" ("CS") is the reference base in wheat genetics and genomics. Pericentric rearrangements in this genotype were systematically assessed by analyzing homoeoloci for a set of nonredundant genesfrom Brachypodium distachyon, Triticum urartu, and Aegilops tauschii in the CS chromosome shotgun sequence obtained from individual chromosome arms flow-sorted from CS aneuploid lines. Based on patterns of their homoeologous arm locations, 551 genes indicated the presence of pericentric inversions in at least 10 of the 21 chromosomes. Available data from deletion bin-mapped expressed sequence tags and genetic mapping in wheat indicated that all inversions had breakpoints in the low-recombinant gene-poor pericentromeric regions. The large number of putative intrachromosomal rearrangements suggests the presence of extensive structural differences among the three subgenomes, at least some of which likely occurred during the production of
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GBP501%2F12%2FG090" target="_blank" >GBP501/12/G090: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Genome Biology and Evolution
ISSN
1759-6653
e-ISSN
—
Svazek periodika
6
Číslo periodika v rámci svazku
11
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
3039-3048
Kód UT WoS článku
000347000200005
EID výsledku v databázi Scopus
—