Molecular organization and comparative analysis of chromosome 5B of the wild wheat ancestor Triticum dicoccoides
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F15%3A00447026" target="_blank" >RIV/61389030:_____/15:00447026 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep10763" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/srep10763</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep10763" target="_blank" >10.1038/srep10763</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Molecular organization and comparative analysis of chromosome 5B of the wild wheat ancestor Triticum dicoccoides
Popis výsledku v původním jazyce
Wild emmer wheat, Triticum turgidum ssp. dicoccoides is the wild relative of Triticum turgidum, the progenitor of durum and bread wheat, and maintains a rich allelic diversity among its wild populations. The lack of adequate genetic and genomic resources, however, restricts its exploitation in wheat improvement. Here, we report next-generation sequencing of the flow-sorted chromosome 5B of T. dicoccoides to shed light into its genome structure, function and organization by exploring the repetitive elements, protein-encoding genes and putative microRNA and tRNA coding sequences. Comparative analyses with its counterparts in modern and wild wheats suggest clues into the B-genome evolution. Syntenic relationships of chromosome 5B with the model grasses can facilitate further efforts for fine-mapping of traits of interest. Mapping of 5B sequences onto the root transcriptomes of two additional T. dicoccoides genotypes, with contrasting drought tolerances, revealed several thousands of singl
Název v anglickém jazyce
Molecular organization and comparative analysis of chromosome 5B of the wild wheat ancestor Triticum dicoccoides
Popis výsledku anglicky
Wild emmer wheat, Triticum turgidum ssp. dicoccoides is the wild relative of Triticum turgidum, the progenitor of durum and bread wheat, and maintains a rich allelic diversity among its wild populations. The lack of adequate genetic and genomic resources, however, restricts its exploitation in wheat improvement. Here, we report next-generation sequencing of the flow-sorted chromosome 5B of T. dicoccoides to shed light into its genome structure, function and organization by exploring the repetitive elements, protein-encoding genes and putative microRNA and tRNA coding sequences. Comparative analyses with its counterparts in modern and wild wheats suggest clues into the B-genome evolution. Syntenic relationships of chromosome 5B with the model grasses can facilitate further efforts for fine-mapping of traits of interest. Mapping of 5B sequences onto the root transcriptomes of two additional T. dicoccoides genotypes, with contrasting drought tolerances, revealed several thousands of singl
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Scientific Reports
ISSN
2045-2322
e-ISSN
—
Svazek periodika
5
Číslo periodika v rámci svazku
JUN 18
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000356524700001
EID výsledku v databázi Scopus
—