Chromosomal genomics facilitates fine mapping of a Russian wheat aphid resistance gene
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F15%3A00447028" target="_blank" >RIV/61389030:_____/15:00447028 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00122-015-2512-2" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s00122-015-2512-2</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00122-015-2512-2" target="_blank" >10.1007/s00122-015-2512-2</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Chromosomal genomics facilitates fine mapping of a Russian wheat aphid resistance gene
Popis výsledku v původním jazyce
Making use of wheat chromosomal resources, we developed 11 gene-associated markers for the region of interest, which allowed reducing gene interval and spanning it by four BAC clones. Positional gene cloning and targeted marker development in bread wheatare hampered by high complexity and polyploidy of its nuclear genome. Aiming to clone a Russian wheat aphid resistance gene Dn2401 located on wheat chromosome arm 7DS, we have developed a strategy overcoming problems due to polyploidy and enabling efficient development of gene-associated markers from the region of interest. We employed information gathered by GenomeZipper, a synteny-based tool combining sequence data of rice, Brachypodium, sorghum and barley, and took advantage of a high-density linkage map of Aegilops tauschii. To ensure genome- and locus-specificity of markers, we made use of survey sequence assemblies of isolated wheat chromosomes 7A, 7B and 7D. Despite the low level of polymorphism of the wheat D subgenome, our app
Název v anglickém jazyce
Chromosomal genomics facilitates fine mapping of a Russian wheat aphid resistance gene
Popis výsledku anglicky
Making use of wheat chromosomal resources, we developed 11 gene-associated markers for the region of interest, which allowed reducing gene interval and spanning it by four BAC clones. Positional gene cloning and targeted marker development in bread wheatare hampered by high complexity and polyploidy of its nuclear genome. Aiming to clone a Russian wheat aphid resistance gene Dn2401 located on wheat chromosome arm 7DS, we have developed a strategy overcoming problems due to polyploidy and enabling efficient development of gene-associated markers from the region of interest. We employed information gathered by GenomeZipper, a synteny-based tool combining sequence data of rice, Brachypodium, sorghum and barley, and took advantage of a high-density linkage map of Aegilops tauschii. To ensure genome- and locus-specificity of markers, we made use of survey sequence assemblies of isolated wheat chromosomes 7A, 7B and 7D. Despite the low level of polymorphism of the wheat D subgenome, our app
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Theoretical and Applied Genetics
ISSN
0040-5752
e-ISSN
—
Svazek periodika
128
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
1373-1383
Kód UT WoS článku
000356148000012
EID výsledku v databázi Scopus
—