Rapid gene isolation in barley and wheat by mutant chromosome sequencing

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F16%3A00465513" target="_blank" >RIV/61389030:_____/16:00465513 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1186/s13059-016-1082-1" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1186/s13059-016-1082-1</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1186/s13059-016-1082-1" target="_blank" >10.1186/s13059-016-1082-1</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Rapid gene isolation in barley and wheat by mutant chromosome sequencing

Popis výsledku v původním jazyce

Identification of causal mutations in barley and wheat is hampered by their large genomes and suppressed recombination. To overcome these obstacles, we have developed MutChromSeq, a complexity reduction approach based on flow sorting and sequencing of mutant chromosomes, to identify induced mutations by comparison to parental chromosomes. We apply MutChromSeq to six mutants each of the barley Eceriferum-q gene and the wheat Pm2 genes. This approach unambiguously identified single candidate genes that were verified by Sanger sequencing of additional mutants. MutChromSeq enables reference-free forward genetics in barley and wheat, thus opening up their pan-genomes to functional genomics.

Název v anglickém jazyce

Rapid gene isolation in barley and wheat by mutant chromosome sequencing

Popis výsledku anglicky

Identification of causal mutations in barley and wheat is hampered by their large genomes and suppressed recombination. To overcome these obstacles, we have developed MutChromSeq, a complexity reduction approach based on flow sorting and sequencing of mutant chromosomes, to identify induced mutations by comparison to parental chromosomes. We apply MutChromSeq to six mutants each of the barley Eceriferum-q gene and the wheat Pm2 genes. This approach unambiguously identified single candidate genes that were verified by Sanger sequencing of additional mutants. MutChromSeq enables reference-free forward genetics in barley and wheat, thus opening up their pan-genomes to functional genomics.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Genome Biology

ISSN

1465-6906

e-ISSN

—

Svazek periodika

17

Číslo periodika v rámci svazku

OCT 31

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000386392200001

EID výsledku v databázi Scopus

—