Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Flow cytometric characterisation of the complex polyploid genome of Saccharum officinarum and modern sugarcane cultivars

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F19%3A00522098" target="_blank" >RIV/61389030:_____/19:00522098 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.nature.com/articles/s41598-019-55652-3" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41598-019-55652-3</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-55652-3" target="_blank" >10.1038/s41598-019-55652-3</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Flow cytometric characterisation of the complex polyploid genome of Saccharum officinarum and modern sugarcane cultivars

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Sugarcane (Saccharum spp.) is a globally important crop for sugar and bioenergy production. Its highly polyploid, complex genome has hindered progress in understanding its molecular structure. Flow cytometric sorting and analysis has been used in other important crops with large genomes to dissect the genome into component chromosomes. Here we present for the first time a method to prepare suspensions of intact sugarcane chromosomes for flow cytometric analysis and sorting. Flow karyotypes were generated for two S. officinarum and three hybrid cultivars. Five main peaks were identified and each genotype had a distinct flow karyotype profile. The flow karyotypes of S. officinarum were sharper and with more discrete peaks than the hybrids, this difference is probably due to the double genome structure of the hybrids. Simple Sequence Repeat (SSR) markers were used to determine that at least one allelic copy of each of the 10 basic chromosomes could be found in each peak for every genotype, except R570, suggesting that the peaks may represent ancestral Saccharum sub genomes. The ability to flow sort Saccharum chromosomes will allow us to isolate and analyse chromosomes of interest and further examine the structure and evolution of the sugarcane genome.

  • Název v anglickém jazyce

    Flow cytometric characterisation of the complex polyploid genome of Saccharum officinarum and modern sugarcane cultivars

  • Popis výsledku anglicky

    Sugarcane (Saccharum spp.) is a globally important crop for sugar and bioenergy production. Its highly polyploid, complex genome has hindered progress in understanding its molecular structure. Flow cytometric sorting and analysis has been used in other important crops with large genomes to dissect the genome into component chromosomes. Here we present for the first time a method to prepare suspensions of intact sugarcane chromosomes for flow cytometric analysis and sorting. Flow karyotypes were generated for two S. officinarum and three hybrid cultivars. Five main peaks were identified and each genotype had a distinct flow karyotype profile. The flow karyotypes of S. officinarum were sharper and with more discrete peaks than the hybrids, this difference is probably due to the double genome structure of the hybrids. Simple Sequence Repeat (SSR) markers were used to determine that at least one allelic copy of each of the 10 basic chromosomes could be found in each peak for every genotype, except R570, suggesting that the peaks may represent ancestral Saccharum sub genomes. The ability to flow sort Saccharum chromosomes will allow us to isolate and analyse chromosomes of interest and further examine the structure and evolution of the sugarcane genome.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_019%2F0000827" target="_blank" >EF16_019/0000827: Rostliny jako prostředek udržitelného globálního rozvoje</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Scientific Reports

  • ISSN

    2045-2322

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    DEC 18

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    19362

  • Kód UT WoS článku

    000507594500002

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85076886234