Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F21%3A00545921" target="_blank" >RIV/61389030:_____/21:00545921 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://doi.org/10.1038/s41588-021-00807-0" target="_blank" >http://doi.org/10.1038/s41588-021-00807-0</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41588-021-00807-0" target="_blank" >10.1038/s41588-021-00807-0</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential

Popis výsledku v původním jazyce

Rye (Secale cereale L.) is an exceptionally climate-resilient cereal crop, used extensively to produce improved wheat varieties via introgressive hybridization and possessing the entire repertoire of genes necessary to enable hybrid breeding. Rye is allogamous and only recently domesticated, thus giving cultivated ryes access to a diverse and exploitable wild gene pool. To further enhance the agronomic potential of rye, we produced a chromosome-scale annotated assembly of the 7.9-gigabase rye genome and extensively validated its quality by using a suite of molecular genetic resources. We demonstrate applications of this resource with a broad range of investigations. We present findings on cultivated rye’s incomplete genetic isolation from wild relatives, mechanisms of genome structural evolution, pathogen resistance, low-temperature tolerance, fertility control systems for hybrid breeding and the yield benefits of rye-wheat introgressions.

Název v anglickém jazyce

Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential

Popis výsledku anglicky

Rye (Secale cereale L.) is an exceptionally climate-resilient cereal crop, used extensively to produce improved wheat varieties via introgressive hybridization and possessing the entire repertoire of genes necessary to enable hybrid breeding. Rye is allogamous and only recently domesticated, thus giving cultivated ryes access to a diverse and exploitable wild gene pool. To further enhance the agronomic potential of rye, we produced a chromosome-scale annotated assembly of the 7.9-gigabase rye genome and extensively validated its quality by using a suite of molecular genetic resources. We demonstrate applications of this resource with a broad range of investigations. We present findings on cultivated rye’s incomplete genetic isolation from wild relatives, mechanisms of genome structural evolution, pathogen resistance, low-temperature tolerance, fertility control systems for hybrid breeding and the yield benefits of rye-wheat introgressions.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Nature Genetics

ISSN

1061-4036

e-ISSN

1546-1718

Svazek periodika

53

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

564-573

Kód UT WoS článku

000630267000002

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85102987124