Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Epigenetic distribution of recombinant plant chromosome fragments in a human–arabidopsis hybrid cell line

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F21%3A00547644" target="_blank" >RIV/61389030:_____/21:00547644 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://doi.org/10.3390/ijms22115426" target="_blank" >http://doi.org/10.3390/ijms22115426</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms22115426" target="_blank" >10.3390/ijms22115426</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Epigenetic distribution of recombinant plant chromosome fragments in a human–arabidopsis hybrid cell line

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Methylation systems have been conserved during the divergence of plants and animals, although they are regulated by different pathways and enzymes. However, studies on the interactions of the epigenomes among evolutionarily distant organisms are lacking. To address this, we studied the epigenetic modification and gene expression of plant chromosome fragments (~30 Mb) in a human–Arabidopsis hybrid cell line. The whole-genome bisulfite sequencing results demonstrated that recombinant Arabidopsis DNA could retain its plant CG methylation levels even without functional plant methyltransferases, indicating that plant DNA methylation states can be maintained even in a different genomic background. The differential methylation analysis showed that the Arabidopsis DNA was undermethylated in the centromeric region and repetitive elements. Several Arabidopsis genes were still expressed, whereas the expression patterns were not related to the gene function. We concluded that the plant DNA did not maintain the original plant epigenomic landscapes and was under the control of the human genome. This study showed how two diverging genomes can coexist and provided insights into epigenetic modifications and their impact on the regulation of gene expressions between plant and animal genomes.

  • Název v anglickém jazyce

    Epigenetic distribution of recombinant plant chromosome fragments in a human–arabidopsis hybrid cell line

  • Popis výsledku anglicky

    Methylation systems have been conserved during the divergence of plants and animals, although they are regulated by different pathways and enzymes. However, studies on the interactions of the epigenomes among evolutionarily distant organisms are lacking. To address this, we studied the epigenetic modification and gene expression of plant chromosome fragments (~30 Mb) in a human–Arabidopsis hybrid cell line. The whole-genome bisulfite sequencing results demonstrated that recombinant Arabidopsis DNA could retain its plant CG methylation levels even without functional plant methyltransferases, indicating that plant DNA methylation states can be maintained even in a different genomic background. The differential methylation analysis showed that the Arabidopsis DNA was undermethylated in the centromeric region and repetitive elements. Several Arabidopsis genes were still expressed, whereas the expression patterns were not related to the gene function. We concluded that the plant DNA did not maintain the original plant epigenomic landscapes and was under the control of the human genome. This study showed how two diverging genomes can coexist and provided insights into epigenetic modifications and their impact on the regulation of gene expressions between plant and animal genomes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_019%2F0000827" target="_blank" >EF16_019/0000827: Rostliny jako prostředek udržitelného globálního rozvoje</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Molecular Sciences

  • ISSN

    1422-0067

  • e-ISSN

    1422-0067

  • Svazek periodika

    22

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    5426

  • Kód UT WoS článku

    000660187400001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85106293642