Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

In‐depth sequence analysis of bread wheat vrn1 genes

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F21%3A00553364" target="_blank" >RIV/61389030:_____/21:00553364 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68081707:_____/21:00554436 RIV/61989592:15310/21:73609382

  • Výsledek na webu

    <a href="http://doi.org/10.3390/ijms222212284" target="_blank" >http://doi.org/10.3390/ijms222212284</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms222212284" target="_blank" >10.3390/ijms222212284</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    In‐depth sequence analysis of bread wheat vrn1 genes

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The VERNALIZATION1 (VRN1) gene encodes a MADS‐box transcription factor and plays an important role in the cold‐induced transition from the vegetative to reproductive stage. Allelic variability of VRN1 homoeologs has been associated with large differences in flowering time. The aim of this study was to investigate the genetic variability of VRN1 homoeologs (VRN‐A1, VRN‐B1 and VRN‐D1). We performed an in‐depth sequence analysis of VRN1 homoeologs in a panel of 105 winter and spring varieties of hexaploid wheat. We describe the novel allele Vrn‐B1f with an 836 bp insertion within intron 1 and show its specific expression pattern associated with reduced heading time. We further provide the complete sequence of the Vrn‐A1b allele, revealing a 177 bp insertion in intron 1, which is transcribed into an alternative splice variant. Copy number variation (CNV) analysis of VRN1 homoeologs showed that VRN‐B1 and VRN‐D1 are present in only one copy. The copy number of recessive vrn‐A1 ranged from one to four, while that of dominant Vrn‐A1 was one or two. Different numbers of Vrn‐A1a copies in the spring cultivars Branisovicka IX/49 and Bastion did not significantly affect heading time. We also report on the deletion of secondary structures (G-quadruplex) in promoter sequences of cultivars with more vrn‐A1 copies.

  • Název v anglickém jazyce

    In‐depth sequence analysis of bread wheat vrn1 genes

  • Popis výsledku anglicky

    The VERNALIZATION1 (VRN1) gene encodes a MADS‐box transcription factor and plays an important role in the cold‐induced transition from the vegetative to reproductive stage. Allelic variability of VRN1 homoeologs has been associated with large differences in flowering time. The aim of this study was to investigate the genetic variability of VRN1 homoeologs (VRN‐A1, VRN‐B1 and VRN‐D1). We performed an in‐depth sequence analysis of VRN1 homoeologs in a panel of 105 winter and spring varieties of hexaploid wheat. We describe the novel allele Vrn‐B1f with an 836 bp insertion within intron 1 and show its specific expression pattern associated with reduced heading time. We further provide the complete sequence of the Vrn‐A1b allele, revealing a 177 bp insertion in intron 1, which is transcribed into an alternative splice variant. Copy number variation (CNV) analysis of VRN1 homoeologs showed that VRN‐B1 and VRN‐D1 are present in only one copy. The copy number of recessive vrn‐A1 ranged from one to four, while that of dominant Vrn‐A1 was one or two. Different numbers of Vrn‐A1a copies in the spring cultivars Branisovicka IX/49 and Bastion did not significantly affect heading time. We also report on the deletion of secondary structures (G-quadruplex) in promoter sequences of cultivars with more vrn‐A1 copies.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA19-05445S" target="_blank" >GA19-05445S: Studium molekulárních mechanismů vernalizace u pšenice</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Molecular Sciences

  • ISSN

    1422-0067

  • e-ISSN

    1422-0067

  • Svazek periodika

    22

  • Číslo periodika v rámci svazku

    22

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    20

  • Strana od-do

    12284

  • Kód UT WoS článku

    000725873100001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85118928059