Topologie DNA ovlivňuje sekvenčně-specifickou vazbu proteinu p53 na DNA prostřednictvím strukturních přechodů cílových míst.
Popis výsledku
Nádorový supresorový protein p53 patří mezi nejdůležitější faktory regulující buněčnou proliferaci, diferenciaci a programovou buněčnou smrt v odpovědi na rozličné buněčné stresové signály. Protein p53 je jaderný fosfoprotein a jeho biochemické funkce jsou těsně spjaty s jeho schopností vázat se sekvenčně-specificky na DNA a působit jako transkripční faktor. Použitím kompetičních technik jsme zkoumali vliv topologie DNA na vazbu standardního lidského proteinu p53 na DNA. Při superhelikální hustotě vyššínež -0,03 byl relativní efekt DNA-superhelicity na interakci mezi proteinem p53 a DNA podobný jak pro DNA obsahující symetrické tak i pro DNA s nesymetrickým vazebným místem. Při více negativních superhelikálních hustotách cílová místa s perfektně palindromatickými sekvencemi vykazovala významnější zvýšení vazby p53 než vazebná místa s porušenou palindromatickou symetrií.
Klíčová slova
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68081707:_____/08:00309774
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites.
Popis výsledku v původním jazyce
Tumor suppressor protein p53 is one of the most important factors regulating cell proliferation, differentiation and programmed cell death in response to a variety of cellular stress signals. The p53 is a nuclear phosphoprotein, and its biochemical function is closely associated with the ability to bind DNA in a sequence-specific manner and operate as a transcription factor. Using a competition assay, we investigated the effect of the DNA topology on the DNA binding of human wild type p53 protein. At superhelix density higher than -??0.03, the relative effect of DNA supercoiling on the protein-DNA binding was similar for DNAs bearing both symmetrical and non-symmetrical target sites. On the other hand, at higher negative superhelix density the target sites with a perfect inverted repeat sequence exhibited a more significant enhancement of p53 binding due to increasing levels of negative DNA supercoiling.
Název v anglickém jazyce
DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites.
Popis výsledku anglicky
Tumor suppressor protein p53 is one of the most important factors regulating cell proliferation, differentiation and programmed cell death in response to a variety of cellular stress signals. The p53 is a nuclear phosphoprotein, and its biochemical function is closely associated with the ability to bind DNA in a sequence-specific manner and operate as a transcription factor. Using a competition assay, we investigated the effect of the DNA topology on the DNA binding of human wild type p53 protein. At superhelix density higher than -??0.03, the relative effect of DNA supercoiling on the protein-DNA binding was similar for DNAs bearing both symmetrical and non-symmetrical target sites. On the other hand, at higher negative superhelix density the target sites with a perfect inverted repeat sequence exhibited a more significant enhancement of p53 binding due to increasing levels of negative DNA supercoiling.
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Biochemical Journal
ISSN
—
e-ISSN
—
Svazek periodika
412
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
57-63
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—
Základní informace
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Rok uplatnění
2008