Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Rho GTPases: deciphering the evolutionary history of a complex protein family

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61988987%3A17310%2F12%3AA1301768" target="_blank" >RIV/61988987:17310/12:A1301768 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Rho GTPases: deciphering the evolutionary history of a complex protein family

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We ruminate on several aspects of the evolutionary history of the Rho family and methodical challenges of its reconstruction. First, we provide an updated survey of Rho GTPases in diverse eukaryotic branches, demonstrating almost ubiquitous occurrence ofRho genes across the eukaryotic phylogeny most consistent with the presence of at least one Rho gene already in the last eukaryotic common ancestor. Second, we discuss the obstacles in reconstructing the history of gene duplications giving rise to the extant diversity of Rho paralogs in different species, and point to numerous limitations posed by the current phylogenetic methodology. Third, as a case study demonstrating various issues of data collection, phylogenetic analyses and interpretations of trees, we present an analysis of the Rho family in the fungal kingdom, revealing the existence of at least four separate paralogs in early fungi and subsequent potentially independent expansions of the family in different fungal subgroups.

  • Název v anglickém jazyce

    Rho GTPases: deciphering the evolutionary history of a complex protein family

  • Popis výsledku anglicky

    We ruminate on several aspects of the evolutionary history of the Rho family and methodical challenges of its reconstruction. First, we provide an updated survey of Rho GTPases in diverse eukaryotic branches, demonstrating almost ubiquitous occurrence ofRho genes across the eukaryotic phylogeny most consistent with the presence of at least one Rho gene already in the last eukaryotic common ancestor. Second, we discuss the obstacles in reconstructing the history of gene duplications giving rise to the extant diversity of Rho paralogs in different species, and point to numerous limitations posed by the current phylogenetic methodology. Third, as a case study demonstrating various issues of data collection, phylogenetic analyses and interpretations of trees, we present an analysis of the Rho family in the fungal kingdom, revealing the existence of at least four separate paralogs in early fungi and subsequent potentially independent expansions of the family in different fungal subgroups.

Klasifikace

  • Druh

    C - Kapitola v odborné knize

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GAP305%2F10%2F0205" target="_blank" >GAP305/10/0205: Nadrodina Ras GTPáz a evoluce eukaryotické buňky</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název knihy nebo sborníku

    Rho GTPases. Methods and Protocols.

  • ISBN

    978-1-61779-441-4

  • Počet stran výsledku

    22

  • Strana od-do

    13-34

  • Počet stran knihy

    407

  • Název nakladatele

    Humana Press

  • Místo vydání

  • Kód UT WoS kapitoly