Plastid and nuclear genomic resources of a relict and endangered plant species- Chamaedaphne calyculata (L.) Moench (Ericaceae).

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61988987%3A17310%2F14%3AA1501C0K" target="_blank" >RIV/61988987:17310/14:A1501C0K - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Plastid and nuclear genomic resources of a relict and endangered plant species- Chamaedaphne calyculata (L.) Moench (Ericaceae).

Popis výsledku v původním jazyce

Chamaedaphne calyculata, one of the largest shrubs in the family Ericaceae, is native to boreal zones of the northern hemisphere. The complete nucleotide sequence of the Chamaedaphne plastid genome was determined in the present study. The genome is a circular double-stranded DNA molecule 176,744 bp in length, that includes the typical large single-copy (LSC), small single-copy, and 2 inverted repeats (IR) regions. The C. calyculata plastid genome contains 113 genes, excluding the second IR region. A comparative analysis revealed that the plastid genome organization of the Chamaedaphne plastome is almost identical to that of Vaccinium macrocarpon, the first sequenced chloroplast genome from the family Ericaceae. The most profound changes were observed in regions IRa and IRb, which additionally contain rpl23 and rps14 genes and duplications of trnfM-CAU and trnG-UCC in LSC.

Název v anglickém jazyce

Plastid and nuclear genomic resources of a relict and endangered plant species- Chamaedaphne calyculata (L.) Moench (Ericaceae).

Popis výsledku anglicky

Chamaedaphne calyculata, one of the largest shrubs in the family Ericaceae, is native to boreal zones of the northern hemisphere. The complete nucleotide sequence of the Chamaedaphne plastid genome was determined in the present study. The genome is a circular double-stranded DNA molecule 176,744 bp in length, that includes the typical large single-copy (LSC), small single-copy, and 2 inverted repeats (IR) regions. The C. calyculata plastid genome contains 113 genes, excluding the second IR region. A comparative analysis revealed that the plastid genome organization of the Chamaedaphne plastome is almost identical to that of Vaccinium macrocarpon, the first sequenced chloroplast genome from the family Ericaceae. The most profound changes were observed in regions IRa and IRb, which additionally contain rpl23 and rps14 genes and duplications of trnfM-CAU and trnG-UCC in LSC.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EF - Botanika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LO1208" target="_blank" >LO1208: Teoretické aspekty energetického zpracování odpadů a ochrany prostředí před negativními dopady</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Turkish Journal of Botany

ISSN

1303-6106

e-ISSN

—

Svazek periodika

6

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

TR - Turecká republika

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

1229-1238

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—