Comparison of ITS-PCR-RFLP and MALDI- TOF MS Methods for the Identification of Wood- Decaying Fungi of the Genus Ganoderma

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61988987%3A17310%2F17%3AA1801OAL" target="_blank" >RIV/61988987:17310/17:A1801OAL - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2017_06_388-391.pdf" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2017_06_388-391.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

slovinština

Název v původním jazyce

Porovnanie ITS-PCR-RFLP a MALDI-TOF MS metód pri identifikácii drevoznehodnocujúcich húb z rodu Ganoderma

Popis výsledku v původním jazyce

Tradičná druhová identifikácia zástupcov rodu Ganoderma je založená na anatomických a morfologických charakteristikách ich bazídiokarpov. V tejto štúdii bola porovnaná schopnosť novo aplikovanej metódy MALDI-TOF MS a známej metódy ITS-PCR-RFLP pre identifikáciu drevorozkladajúcich húb rodu Ganoderma. Anatomicko-morfologickou analýzou siedmich vzoriek plodníc sme determinovali štyri druhy. Restrikčná analýza ukázala tiež prítomnosť štyroch druhov. Rovnako MALDI-TOF MS analýzou boli získané druhovo špecifické spektrá štyroch druhov rodu Ganoderma. Zo získaných spektier bola urobená zhluková analýza. Výsledky ukázali, že MALDI-TOF MS analýza je schopná rozlíšiť testované druhy s porovnateľnou presnosťou ako ITS-PCR-RFLP analýza a môže byť využitá pri identifikácii druhov rodu Ganoderma.

Název v anglickém jazyce

Comparison of ITS-PCR-RFLP and MALDI- TOF MS Methods for the Identification of Wood- Decaying Fungi of the Genus Ganoderma

Popis výsledku anglicky

The traditional identification of the species of the genus Ganoderma is based on its anatomical and morphological characteristics of basidiocarps. In this study, ability of newly applied method MALDI-TOF MS and known ITSPCR-RFLP have been compared for the identification of fungi of the genus. The samples of seven members of the genus have been determined based on its anatomical and morphological traits and four species have been identified. Restriction analysis also showed the presence of four species of the genus. MALDI-TOF MS analysis yielded well defined spectra for all species tested. The cluster analysis has been carried out from the spectra obtained. The results have shown that MALDI-TOF MS is capable to distinguish among studied fungi with an accuracy comparable to ITSPCR-RFLP and could be used for identification of fungi of the genus Ganoderma.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10612 - Mycology

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

CHEM LISTY

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Svazek periodika

111

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

388-391

Kód UT WoS článku

000410766200006

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85021726217