Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Transcriptome of Lafontella sp., an obscure relative of Phytomonas and Herpetomonas

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61988987%3A17310%2F23%3AA2402O4H" target="_blank" >RIV/61988987:17310/23:A2402O4H - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60076658:12310/23:43907857 RIV/00216208:11310/23:10477123

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.parazitologie.cz/protozoologie/Personal%20homepages/Votypka/Transcriptome_Lafontella_2023_Protistology.pdf" target="_blank" >https://www.parazitologie.cz/protozoologie/Personal%20homepages/Votypka/Transcriptome_Lafontella_2023_Protistology.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.21685/1680-0826-2023-17-2-6" target="_blank" >10.21685/1680-0826-2023-17-2-6</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Transcriptome of Lafontella sp., an obscure relative of Phytomonas and Herpetomonas

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The trypanosomatid subfamily Herpetomonadinae includes plant-pathogenic dixenous genus Phytomonas as well as two sister monoxenous genera – Herpetomonas and Lafontella. The latter one is very poorly studied with the only information on its biology being its affinity to muscid and calliforid flies and the inability to survive at elevated temperature. To shed more light on this obscure genus and get insights into the evolution of gene content in the subfamily Herpetomonadinae, we conducted transcriptome sequencing of Lafontella sp. GMO-01 and comparative analysis of its predicted arsenal of proteins with those of other trypanosomatids. Our results show considerable similarity between the two monoxenous genera of Herpetomonadinae in the total number of proteins, exceeding that in the majority of other trypanosomatids as well as content of functional orthogroups. Using Lafontella and Herpetomonas as the closest outgroups allowed inferring the genes uniquely lost by Phytomonas, their dixenous cousin. The fact that GC content of Lafontella is intermediate between that of Herpetomonas and Phytomonas correlating with the phylogenetic distances separating the three genera suggests that a more thorough analysis of this flagellate can shed new light on the origin of dixeny in this subfamily

  • Název v anglickém jazyce

    Transcriptome of Lafontella sp., an obscure relative of Phytomonas and Herpetomonas

  • Popis výsledku anglicky

    The trypanosomatid subfamily Herpetomonadinae includes plant-pathogenic dixenous genus Phytomonas as well as two sister monoxenous genera – Herpetomonas and Lafontella. The latter one is very poorly studied with the only information on its biology being its affinity to muscid and calliforid flies and the inability to survive at elevated temperature. To shed more light on this obscure genus and get insights into the evolution of gene content in the subfamily Herpetomonadinae, we conducted transcriptome sequencing of Lafontella sp. GMO-01 and comparative analysis of its predicted arsenal of proteins with those of other trypanosomatids. Our results show considerable similarity between the two monoxenous genera of Herpetomonadinae in the total number of proteins, exceeding that in the majority of other trypanosomatids as well as content of functional orthogroups. Using Lafontella and Herpetomonas as the closest outgroups allowed inferring the genes uniquely lost by Phytomonas, their dixenous cousin. The fact that GC content of Lafontella is intermediate between that of Herpetomonas and Phytomonas correlating with the phylogenetic distances separating the three genera suggests that a more thorough analysis of this flagellate can shed new light on the origin of dixeny in this subfamily

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>ost</sub> - Ostatní články v recenzovaných periodicích

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA23-07695S" target="_blank" >GA23-07695S: Zkoumání evoluce genomu u eukaryot: poučení z nemodelových euglenozoí</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Protistology

  • ISSN

    1680-0826

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    RU - Ruská federace

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

    109-117

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus