SETD2 loss-of-function promotes renal cancer branched evolution through replication stress and impaired DNA repair

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F15%3A33155690" target="_blank" >RIV/61989592:15110/15:33155690 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/onc.2015.24" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/onc.2015.24</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/onc.2015.24" target="_blank" >10.1038/onc.2015.24</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

SETD2 loss-of-function promotes renal cancer branched evolution through replication stress and impaired DNA repair

Popis výsledku v původním jazyce

Defining mechanisms that generate intratumour heterogeneity and branched evolution may inspire novel therapeutic approaches to limit tumour diversity and adaptation. SETD2 (Su(var), Enhancer of zeste, Trithorax-domain containing 2) trimethylates histone-3 lysine-36 (H3K36me3) at sites of active transcription and is mutated in diverse tumour types, including clear cell renal carcinomas (ccRCCs). Distinct SETD2 mutations have been identified in spatially separated regions in ccRCC, indicative of intratumour heterogeneity. In this study, we have addressed the consequences of SETD2 loss-of-function through an integrated bioinformatics and functional genomics approach. We find that bi-allelic SETD2 aberrations are not associated with microsatellite instability in ccRCC. SETD2 depletion in ccRCC cells revealed aberrant and reduced nucleosome compaction and chromatin association of the key replication proteins minichromosome maintenance complex component (MCM7) and DNA polymerase delta hinder

Název v anglickém jazyce

SETD2 loss-of-function promotes renal cancer branched evolution through replication stress and impaired DNA repair

Popis výsledku anglicky

Defining mechanisms that generate intratumour heterogeneity and branched evolution may inspire novel therapeutic approaches to limit tumour diversity and adaptation. SETD2 (Su(var), Enhancer of zeste, Trithorax-domain containing 2) trimethylates histone-3 lysine-36 (H3K36me3) at sites of active transcription and is mutated in diverse tumour types, including clear cell renal carcinomas (ccRCCs). Distinct SETD2 mutations have been identified in spatially separated regions in ccRCC, indicative of intratumour heterogeneity. In this study, we have addressed the consequences of SETD2 loss-of-function through an integrated bioinformatics and functional genomics approach. We find that bi-allelic SETD2 aberrations are not associated with microsatellite instability in ccRCC. SETD2 depletion in ccRCC cells revealed aberrant and reduced nucleosome compaction and chromatin association of the key replication proteins minichromosome maintenance complex component (MCM7) and DNA polymerase delta hinder

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Oncogene

ISSN

0950-9232

e-ISSN

—

Svazek periodika

34

Číslo periodika v rámci svazku

46

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

5699-5708

Kód UT WoS článku

000364594600002

EID výsledku v databázi Scopus

—