Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Genome sequence of the opportunistic human pathogen Magnusiomyces capitatus

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F18%3A73593438" target="_blank" >RIV/61989592:15110/18:73593438 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60077344:_____/19:00518828

  • Výsledek na webu

    <a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s00294-018-0904-y" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007/s00294-018-0904-y</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00294-018-0904-y" target="_blank" >10.1007/s00294-018-0904-y</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Genome sequence of the opportunistic human pathogen Magnusiomyces capitatus

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The yeast Magnusiomyces capitatus is an opportunistic human pathogen causing rare yet severe infections, especially in patients with hematological malignancies. Here, we report the 20.2 megabase genome sequence of an environmental strain of this species as well as the genome sequences of eight additional isolates from human and animal sources providing an insight into intraspecies variation. The distribution of single-nucleotide variants is indicative of genetic recombination events, supporting evidence for sexual reproduction in this heterothallic yeast. Using RNAseq-aided annotation, we identified genes for 6518 proteins including several expanded families such as kexin proteases and Hsp70 molecular chaperones. Several of these families are potentially associated with the ability of M. capitatus to infect and colonize humans. For the purpose of comparative analysis, we also determined the genome sequence of a closely related yeast, Magnusiomyces ingens. The genome sequences of M. capitatus and M. ingens exhibit many distinct features and represent a basis for further comparative and functional studies. © 2018, Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature.

  • Název v anglickém jazyce

    Genome sequence of the opportunistic human pathogen Magnusiomyces capitatus

  • Popis výsledku anglicky

    The yeast Magnusiomyces capitatus is an opportunistic human pathogen causing rare yet severe infections, especially in patients with hematological malignancies. Here, we report the 20.2 megabase genome sequence of an environmental strain of this species as well as the genome sequences of eight additional isolates from human and animal sources providing an insight into intraspecies variation. The distribution of single-nucleotide variants is indicative of genetic recombination events, supporting evidence for sexual reproduction in this heterothallic yeast. Using RNAseq-aided annotation, we identified genes for 6518 proteins including several expanded families such as kexin proteases and Hsp70 molecular chaperones. Several of these families are potentially associated with the ability of M. capitatus to infect and colonize humans. For the purpose of comparative analysis, we also determined the genome sequence of a closely related yeast, Magnusiomyces ingens. The genome sequences of M. capitatus and M. ingens exhibit many distinct features and represent a basis for further comparative and functional studies. © 2018, Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>SC</sub> - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10303 - Particles and field physics

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Current Genetics

  • ISSN

    0172-8083

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    65

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    22

  • Strana od-do

    539-560

  • Kód UT WoS článku

    000461396800028

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85056814450