Methods for simultaneous and quantitative isolation of mitochondrial DNA, nuclear DNA and RNA from mammalian cells
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F20%3A73605083" target="_blank" >RIV/61989592:15110/20:73605083 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://www.future-science.com/doi/pdf/10.2144/btn-2020-0114" target="_blank" >https://www.future-science.com/doi/pdf/10.2144/btn-2020-0114</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.2144/btn-2020-0114" target="_blank" >10.2144/btn-2020-0114</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Methods for simultaneous and quantitative isolation of mitochondrial DNA, nuclear DNA and RNA from mammalian cells
Popis výsledku v původním jazyce
The aim of this study was to assess two protocols for their capacities to simultaneously isolate RNA, mtDNA and ncDNA from mammalian cells. We compared the Invitrogen TRIzol-based method and Qiagen DNeasy columns, using the HepG2 cell line and human primary glioblastoma stem cells. Both methods allowed the isolation of all three types of nucleic acids and provided similar yields in mtDNA. However, the yield in ncDNA was more than tenfold higher on columns, as observed for both cell types. Conversely, the TRIzol method proved more reproducible and was the method of choice for isolating RNA from glioblastoma cells, as demonstrated for the housekeeping genes RPLP0 and RPS9.
Název v anglickém jazyce
Methods for simultaneous and quantitative isolation of mitochondrial DNA, nuclear DNA and RNA from mammalian cells
Popis výsledku anglicky
The aim of this study was to assess two protocols for their capacities to simultaneously isolate RNA, mtDNA and ncDNA from mammalian cells. We compared the Invitrogen TRIzol-based method and Qiagen DNeasy columns, using the HepG2 cell line and human primary glioblastoma stem cells. Both methods allowed the isolation of all three types of nucleic acids and provided similar yields in mtDNA. However, the yield in ncDNA was more than tenfold higher on columns, as observed for both cell types. Conversely, the TRIzol method proved more reproducible and was the method of choice for isolating RNA from glioblastoma cells, as demonstrated for the housekeeping genes RPLP0 and RPS9.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
O - Projekt operacniho programu
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
BIOTECHNIQUES
ISSN
0736-6205
e-ISSN
—
Svazek periodika
69
Číslo periodika v rámci svazku
6
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
436-442
Kód UT WoS článku
000586664200001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85097930060