METHOD OF IDENTIFICATION OF ENTITIES FROM MASS SPECTRA

Kód výsledku v IS VaVaI

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Výsledek na webu

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DOI - Digital Object Identifier

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Jazyk výsledku

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Název v původním jazyce

質量スペクトルからの存在物の同定の方法

Popis výsledku v původním jazyce

本発明は、 少なくとも１つの存在物の質量スペクトル、および任意に当該少なくとも１つの存在物の化学的、物理的、生化学的または生物学的な分析からの追加のデータからの、当該少なくとも１つの存在物の独自性の、各存在物についての、決定のための方法であって、ａ）前記存在物の質量スペクトルから分析データを収集すること、および任意に前記存在物の化学的、物理的、生化学的または生物学的な分析から追加の分析データを収集すること、ｂ）より高い出現率を有しているすべての独自性候補が複数の独自性候補に含まれていることは、独自性候補のそれぞれについて当てはまるので、前記存在物の複数の独自性候補を取得すること、および当該存在物の当該複数の独自性候補の出現率を取得すること；ｃ）少なくとも存在物の出現率、または少なくとも、存在物の出現率および質量スペクトルとの一致に関する、存在物の独自性候補のそれぞれについての、独自性候補のスコアの計算、ｄ）存在物の独自性を、前記存在物の真の独自性におそらく対応するスコアに最も近いスコアを有している独自性候補として、決定することのステップを含んでいる、方法に関する。前記存在物は、任意の化学的または生物学的な存在物、特にペプチド、タンパク質、脂質、核酸、代謝産物または小分子であり得る。前記存在物の独自性の決定は、ショットガンプロテオミクスおよび多くの他の分野一般で出くわす質量スペクトルの解釈の問題を解決する。本発明の前記方法はまた、独自性の決定のため、特に細胞株の鑑定のため、またはプロテオームの質量スペクトルからの個人の同定のために使用され得る。前記方法はまた、宿主生物のプロテオームの質量スペクトルからの非宿主生物の同定のため、特に微生物感染または微生物のコロニー形成の診断のために使用され得る。前記方法はまた、体液タンパク質の質量スペクトルからの腫瘍の存在の同定、または体細胞変異体の存在もしくは非存在を介した腫瘍特性の評価のために使用され得る。前記方法はまた、レシピエントの生物学的材料の質量分析からの、臓器移植のモニタリングおよび移植拒絶の早期検出のために使用され得る。

Název v anglickém jazyce

METHOD OF IDENTIFICATION OF ENTITIES FROM MASS SPECTRA

Popis výsledku anglicky

The present invention relates to a method for determination of identity of at least one entity from a mass spectrum of said at least one entity and optionally from additional data from chemical, physical, biochemical or biological analysis of said at least one entity, for each entity comprising the steps of:a) collecting analytical data from mass spectrum of the entity, and optionally collecting additional analytical data from a chemical, physical, biochemical or biological analysis of the entity,b) obtaining a plurality of candidate identities of the entity and obtaining the prevalences of said candidate identities of the entity, whereas for each candidate identity it applies that all candidate identities with a higher prevalence are included in the plurality of candidate identities;c) for each candidate identity of an entity, calculation of its score, said calculation involving at least prevalence of entity, or at least prevalence of entity and agreement with mass spectrum,d) determining the identity of an entity as the candidate identity with the score closest to the score which would correspond to the true identity of the entity.

Druh

P - Patent

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Číslo patentu nebo vzoru

JP 7218019

Vydavatel

JP001 -

Název vydavatele

Japan Patent Office (JPO)

Místo vydání

Tokyo

Stát vydání

JP - Japonsko

Datum přijetí

27. 1. 2023

Název vlastníka

Univerzita Palackého v Olomouci

Způsob využití

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel

Druh možnosti využití

P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence