Biomarkers of Aspergillus spores: Strain typing and protein identification
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F09%3A00010452" target="_blank" >RIV/61989592:15310/09:00010452 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388971:_____/09:00327084 RIV/61989592:15110/09:00009491 RIV/00216208:11310/09:00013131
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Biomarkers of Aspergillus spores: Strain typing and protein identification
Popis výsledku v původním jazyce
We applied both matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometric and 1D sodium dodecylsulfate polyacrylamide gel electrophoretic (1D-PAGE) approaches for direct analysis of intact fungal spores of twenty four Aspergillus species. In parallel, we optimized various protocols for protein extraction from Aspergillus spores using acidic conditions, step organic gradient and variable sonication treatment. The MALDI-TOF mass spectra obtained from optimally prepared samples provided a reproducible fingerprint demonstrating the capability of the MALDI-TOF approach to type and characterize different fungal strains within the Aspergillus genus. Mass spectra of intact fungal spores provided signals mostly below 20 kDa. TheMinimum material amount represented 0.3 mu g (10,000 spores). Proteins with higher molecular weight were detected by 1 D-PAGE. Eleven proteins were identified from three selected strains in the range 5-25 kDa by the proteomic approach. He
Název v anglickém jazyce
Biomarkers of Aspergillus spores: Strain typing and protein identification
Popis výsledku anglicky
We applied both matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometric and 1D sodium dodecylsulfate polyacrylamide gel electrophoretic (1D-PAGE) approaches for direct analysis of intact fungal spores of twenty four Aspergillus species. In parallel, we optimized various protocols for protein extraction from Aspergillus spores using acidic conditions, step organic gradient and variable sonication treatment. The MALDI-TOF mass spectra obtained from optimally prepared samples provided a reproducible fingerprint demonstrating the capability of the MALDI-TOF approach to type and characterize different fungal strains within the Aspergillus genus. Mass spectra of intact fungal spores provided signals mostly below 20 kDa. TheMinimum material amount represented 0.3 mu g (10,000 spores). Proteins with higher molecular weight were detected by 1 D-PAGE. Eleven proteins were identified from three selected strains in the range 5-25 kDa by the proteomic approach. He
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal of Mass Spectrometry
ISSN
1387-3806
e-ISSN
—
Svazek periodika
280
Číslo periodika v rámci svazku
1-3
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—