Semiempirical Quantum Mechanical Method PM6-DH2X Describes the Geometry and Energetics of CK2-Inhibitor Complexes Involving Halogen Bonds Well, While the Empirical Potential Fails
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F11%3A33119765" target="_blank" >RIV/61989592:15310/11:33119765 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388963:_____/11:00368063
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/jp202149z" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/jp202149z</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/jp202149z" target="_blank" >10.1021/jp202149z</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Semiempirical Quantum Mechanical Method PM6-DH2X Describes the Geometry and Energetics of CK2-Inhibitor Complexes Involving Halogen Bonds Well, While the Empirical Potential Fails
Popis výsledku v původním jazyce
Complexes of CK2 protein kinase with halogenated inhibitors were investigated by means of the advanced semiempirical quantum mechanical PM6-DH2X method. The PM6-DH2X method provides reliable geometries of the CK2 protein kinase-inhibitor complexes that agree well with the X-ray crystal structures. When the Amber empirical potential is applied, this agreement becomes considerably worse. Similarly, the binding free energies determined by the PM6-DH2X SQM method are much closer to the experimental inhibition constants than those based on the Amber empirical potential.
Název v anglickém jazyce
Semiempirical Quantum Mechanical Method PM6-DH2X Describes the Geometry and Energetics of CK2-Inhibitor Complexes Involving Halogen Bonds Well, While the Empirical Potential Fails
Popis výsledku anglicky
Complexes of CK2 protein kinase with halogenated inhibitors were investigated by means of the advanced semiempirical quantum mechanical PM6-DH2X method. The PM6-DH2X method provides reliable geometries of the CK2 protein kinase-inhibitor complexes that agree well with the X-ray crystal structures. When the Amber empirical potential is applied, this agreement becomes considerably worse. Similarly, the binding free energies determined by the PM6-DH2X SQM method are much closer to the experimental inhibition constants than those based on the Amber empirical potential.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Svazek periodika
115
Číslo periodika v rámci svazku
26
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
8581-8589
Kód UT WoS článku
000292281200025
EID výsledku v databázi Scopus
—