MOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F12%3A33142298" target="_blank" >RIV/61989592:15310/12:33142298 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14740/12:00057571

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gks363" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/nar/gks363</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gks363" target="_blank" >10.1093/nar/gks363</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

MOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels

Popis výsledku v původním jazyce

Biomolecular channels play important roles in many biological systems, e.g. enzymes, ribosomes and ion channels. This article introduces a web-based interactive MOLEonline 2.0 application for the analysis of access/egress paths to interior molecular voids. MOLEonline 2.0 enables platform-independent, easy-to-use and interactive analyses of (bio)macromolecular channels, tunnels and pores. Results are presented in a clear manner, making their interpretation easy. For each channel, MOLEonline displays a 3Dgraphical representation of the channel, its profile accompanied by a list of lining residues and also its basic physicochemical properties. The users can tune advanced parameters when performing a channel search to direct the search according to theirneeds. The MOLEonline 2.0 application is freely available via the Internet at http://ncbr.muni.cz/mole or http://mole.upol.cz.

Název v anglickém jazyce

MOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels

Popis výsledku anglicky

Biomolecular channels play important roles in many biological systems, e.g. enzymes, ribosomes and ion channels. This article introduces a web-based interactive MOLEonline 2.0 application for the analysis of access/egress paths to interior molecular voids. MOLEonline 2.0 enables platform-independent, easy-to-use and interactive analyses of (bio)macromolecular channels, tunnels and pores. Results are presented in a clear manner, making their interpretation easy. For each channel, MOLEonline displays a 3Dgraphical representation of the channel, its profile accompanied by a list of lining residues and also its basic physicochemical properties. The users can tune advanced parameters when performing a channel search to direct the search according to theirneeds. The MOLEonline 2.0 application is freely available via the Internet at http://ncbr.muni.cz/mole or http://mole.upol.cz.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Nucleic Acids Research

ISSN

0305-1048

e-ISSN

—

Svazek periodika

40

Číslo periodika v rámci svazku

W1

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

"'W222'"-"'W227'"

Kód UT WoS článku

000306670900036

EID výsledku v databázi Scopus

—