Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Identification of Methanogenic archaea in the Hyporheic Sediment of Sitka Stream

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F13%3A33145014" target="_blank" >RIV/61989592:15310/13:33145014 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0080804" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0080804</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0080804" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0080804</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Identification of Methanogenic archaea in the Hyporheic Sediment of Sitka Stream

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Methanogenic archaea produce methane as a metabolic product under anoxic conditions and they play a crucial role in the global methane cycle. In this study molecular diversity of methanogenic archaea in the hyporheic sediment of the lowland stream Sitka(Olomouc, Czech Republic) was analyzed by PCR amplification, cloning and sequencing analysis of the methyl coenzyme M reductase alpha subunit (mcrA) gene. Sequencing analysis of 60 clones revealed 24 different mcrA phylotypes from hyporheic sedimentary layers to a depth of 50 cm. Phylotypes were affiliated with Methanomicrobiales, Methanosarcinales and Methanobacteriales orders. Only one phylotype remains unclassified. The majority of the phylotypes showed higher affiliation with uncultured methanogensthan with known methanogenic species. The presence of relatively rich assemblage of methanogenic archaea confirmed that methanogens may be an important component of hyporheic microbial communities and may affect CH4 cycling in rivers.

  • Název v anglickém jazyce

    Identification of Methanogenic archaea in the Hyporheic Sediment of Sitka Stream

  • Popis výsledku anglicky

    Methanogenic archaea produce methane as a metabolic product under anoxic conditions and they play a crucial role in the global methane cycle. In this study molecular diversity of methanogenic archaea in the hyporheic sediment of the lowland stream Sitka(Olomouc, Czech Republic) was analyzed by PCR amplification, cloning and sequencing analysis of the methyl coenzyme M reductase alpha subunit (mcrA) gene. Sequencing analysis of 60 clones revealed 24 different mcrA phylotypes from hyporheic sedimentary layers to a depth of 50 cm. Phylotypes were affiliated with Methanomicrobiales, Methanosarcinales and Methanobacteriales orders. Only one phylotype remains unclassified. The majority of the phylotypes showed higher affiliation with uncultured methanogensthan with known methanogenic species. The presence of relatively rich assemblage of methanogenic archaea confirmed that methanogens may be an important component of hyporheic microbial communities and may affect CH4 cycling in rivers.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA526%2F09%2F1639" target="_blank" >GA526/09/1639: Biogeochemie metanu a detekce metanogenních a metanotrofních bakterií v říčních sedimentech</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2013

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS One

  • ISSN

    1932-6203

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    8

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    1-10

  • Kód UT WoS článku

    000327313100113

  • EID výsledku v databázi Scopus