Genetic variability of the Czech Pea enation mosaic virus isolates

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F14%3A33150161" target="_blank" >RIV/61989592:15310/14:33150161 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Genetic variability of the Czech Pea enation mosaic virus isolates

Popis výsledku v původním jazyce

The Pea enation mosaic virus is an example of symbiogenesis of taxonomically unrelated PEMV-1 and PEMV-2 viruses. Partial RNA sequences, PEMV-1 coat protein, PEMV-2 movement protein gene and satellite RNA from seventeen isolates were compared with the aim of enlarging the knowledge of PEMV variability. The isolates showed genetic variability based on the nucleotide sequences in both RNA1 and RNA2, with 98-94% identity within coat protein gene sequences, and 95-96% identity within the movement protein. The phylogenetic analyses showed different evolution of both symbiotic viruses and differences in the European isolates. Most of the differences seen were synonymous without changes in the structure of proteins. The analysis of satellite RNA positive isolates implies a possible correlation between the structure of coat protein gene and presence of RNA3.

Název v anglickém jazyce

Genetic variability of the Czech Pea enation mosaic virus isolates

Popis výsledku anglicky

The Pea enation mosaic virus is an example of symbiogenesis of taxonomically unrelated PEMV-1 and PEMV-2 viruses. Partial RNA sequences, PEMV-1 coat protein, PEMV-2 movement protein gene and satellite RNA from seventeen isolates were compared with the aim of enlarging the knowledge of PEMV variability. The isolates showed genetic variability based on the nucleotide sequences in both RNA1 and RNA2, with 98-94% identity within coat protein gene sequences, and 95-96% identity within the movement protein. The phylogenetic analyses showed different evolution of both symbiotic viruses and differences in the European isolates. Most of the differences seen were synonymous without changes in the structure of proteins. The analysis of satellite RNA positive isolates implies a possible correlation between the structure of coat protein gene and presence of RNA3.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QI91A229" target="_blank" >QI91A229: Konvenční a molekulárně-genetické přístupy při tvorbě luskovin rezistentních vůči virovým a houbovým chorobám a hmyzím škůdcům.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Czech Journal of Genetics and Plant Breeding

ISSN

1212-1975

e-ISSN

—

Svazek periodika

50

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

100-104

Kód UT WoS článku

000342917800009

EID výsledku v databázi Scopus

—