Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

A subtracted cDNA library identifies genes up-regulated during PHOT1-mediated early step of de-etiolation in tomato (Solanum lycopersicum L.)

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F16%3A33162404" target="_blank" >RIV/61989592:15310/16:33162404 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-016-2613-6" target="_blank" >https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-016-2613-6</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1186/s12864-016-2613-6" target="_blank" >10.1186/s12864-016-2613-6</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    A subtracted cDNA library identifies genes up-regulated during PHOT1-mediated early step of de-etiolation in tomato (Solanum lycopersicum L.)

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We generated a subtracted cDNA library using the suppression subtractive hybridization method to investigate the molecular mechanisms of BL-induced de-etiolation in tomato (Solanum lycopersicum L.), an economically important crop. We focused our interest on the first 30 min following the exposure to BL when PHOT1 is required to induce the process. Our library generated 152 expressed sequence tags that were found to be rapidly accumulated upon exposure to BL and consequently potentially regulated by PHOT1. Annotation revealed that biological functions such as modification of chromatin structure, cell wall modification, and transcription/translation comprise an important part of events contributing to the establishment of photomorphogenesis in young tomato seedlings. Our conclusions based on bioinformatics data were supported by qRT-PCR analyses the specific investigation of V-H+-ATPase during de-etiolation in tomato.

  • Název v anglickém jazyce

    A subtracted cDNA library identifies genes up-regulated during PHOT1-mediated early step of de-etiolation in tomato (Solanum lycopersicum L.)

  • Popis výsledku anglicky

    We generated a subtracted cDNA library using the suppression subtractive hybridization method to investigate the molecular mechanisms of BL-induced de-etiolation in tomato (Solanum lycopersicum L.), an economically important crop. We focused our interest on the first 30 min following the exposure to BL when PHOT1 is required to induce the process. Our library generated 152 expressed sequence tags that were found to be rapidly accumulated upon exposure to BL and consequently potentially regulated by PHOT1. Annotation revealed that biological functions such as modification of chromatin structure, cell wall modification, and transcription/translation comprise an important part of events contributing to the establishment of photomorphogenesis in young tomato seedlings. Our conclusions based on bioinformatics data were supported by qRT-PCR analyses the specific investigation of V-H+-ATPase during de-etiolation in tomato.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LO1204" target="_blank" >LO1204: Udržitelný rozvoj výzkumu v Centru regionu Haná</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    BMC Genomics

  • ISSN

    1471-2164

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    17

  • Číslo periodika v rámci svazku

    APR

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    "291-1"-"291-12"

  • Kód UT WoS článku

    000374939300001

  • EID výsledku v databázi Scopus