Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Comparative Digital Gene Expression Analysis of Tissue-Cultured Plantlets of Highly Resistant and Susceptible Banana Cultivars in Response to Fusarium oxysporum

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F18%3A73590433" target="_blank" >RIV/61989592:15310/18:73590433 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/1422-0067/19/2/350/htm" target="_blank" >https://www.mdpi.com/1422-0067/19/2/350/htm</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms19020350" target="_blank" >10.3390/ijms19020350</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Comparative Digital Gene Expression Analysis of Tissue-Cultured Plantlets of Highly Resistant and Susceptible Banana Cultivars in Response to Fusarium oxysporum

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Banana Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) is one of the most destructive soil-borne diseases. In this study, young tissue-cultured plantlets of banana (Musa spp. AAA) cultivars differing in Foc susceptibility were used to reveal their differential responses to this pathogen using digital gene expression (DGE). Data were evaluated by various bioinformatic tools (Venn diagrams, gene ontology (GO) annotation and Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) pathway analyses) and immunofluorescence labelling method to support the identification of gene candidates determining the resistance of banana against Foc. Interestingly, we have identified MaWRKY50 as an important gene involved in both constitutive and induced resistance. We also identified new genes involved in the resistance of banana to Foc, including several other transcription factors (TFs), pathogenesis-related (PR) genes and some genes related to the plant cell wall biosynthesis or degradation (e.g., pectinesterases, -glucosidases, xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase and endoglucanase). The resistant banana cultivar shows activation of PR-3 and PR-4 genes as well as formation of different constitutive cell barriers to restrict spreading of the pathogen. These data suggest new mechanisms of banana resistance to Foc.

  • Název v anglickém jazyce

    Comparative Digital Gene Expression Analysis of Tissue-Cultured Plantlets of Highly Resistant and Susceptible Banana Cultivars in Response to Fusarium oxysporum

  • Popis výsledku anglicky

    Banana Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) is one of the most destructive soil-borne diseases. In this study, young tissue-cultured plantlets of banana (Musa spp. AAA) cultivars differing in Foc susceptibility were used to reveal their differential responses to this pathogen using digital gene expression (DGE). Data were evaluated by various bioinformatic tools (Venn diagrams, gene ontology (GO) annotation and Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) pathway analyses) and immunofluorescence labelling method to support the identification of gene candidates determining the resistance of banana against Foc. Interestingly, we have identified MaWRKY50 as an important gene involved in both constitutive and induced resistance. We also identified new genes involved in the resistance of banana to Foc, including several other transcription factors (TFs), pathogenesis-related (PR) genes and some genes related to the plant cell wall biosynthesis or degradation (e.g., pectinesterases, -glucosidases, xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase and endoglucanase). The resistant banana cultivar shows activation of PR-3 and PR-4 genes as well as formation of different constitutive cell barriers to restrict spreading of the pathogen. These data suggest new mechanisms of banana resistance to Foc.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10611 - Plant sciences, botany

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LO1204" target="_blank" >LO1204: Udržitelný rozvoj výzkumu v Centru regionu Haná</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES

  • ISSN

    1422-0067

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    19

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    18

  • Strana od-do

    "UNSP 350-1"-"UNSP 350-18"

  • Kód UT WoS článku

    000427527400034

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85041047354