Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

New cyanobacterial genus Argonema is hidding in soil crusts around the world

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F22%3A73615062" target="_blank" >RIV/61989592:15310/22:73615062 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.nature.com/articles/s41598-022-11288-4" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41598-022-11288-4</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-11288-4" target="_blank" >10.1038/s41598-022-11288-4</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    New cyanobacterial genus Argonema is hidding in soil crusts around the world

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Cyanobacteria are crucial primary producers in soil and soil crusts. However, their biodiversity in these habitats remains poorly understood, especially in the tropical and polar regions. We employed whole genome sequencing, morphology, and ecology to describe a novel cyanobacterial genus Argonema isolated from Antarctica. Extreme environments are renowned for their relatively high number of endemic species, but whether cyanobacteria are endemic or not is open to much current debate. To determine if a cyanobacterial lineage is endemic is a time consuming, elaborate, and expensive global sampling effort. Thus, we propose an approach that will help to overcome the limits of the sampling effort and better understand the global distribution of cyanobacterial clades. We employed a Sequencing Read Archive, which provides a rich source of data from thousands of environmental samples. We developed a framework for a characterization of the global distribution of any microbial species using Sequencing Read Archive. Using this approach, we found that Argonema is actually cosmopolitan in arid regions. It provides further evidence that endemic microbial taxa are likely to be much rarer than expected.

  • Název v anglickém jazyce

    New cyanobacterial genus Argonema is hidding in soil crusts around the world

  • Popis výsledku anglicky

    Cyanobacteria are crucial primary producers in soil and soil crusts. However, their biodiversity in these habitats remains poorly understood, especially in the tropical and polar regions. We employed whole genome sequencing, morphology, and ecology to describe a novel cyanobacterial genus Argonema isolated from Antarctica. Extreme environments are renowned for their relatively high number of endemic species, but whether cyanobacteria are endemic or not is open to much current debate. To determine if a cyanobacterial lineage is endemic is a time consuming, elaborate, and expensive global sampling effort. Thus, we propose an approach that will help to overcome the limits of the sampling effort and better understand the global distribution of cyanobacterial clades. We employed a Sequencing Read Archive, which provides a rich source of data from thousands of environmental samples. We developed a framework for a characterization of the global distribution of any microbial species using Sequencing Read Archive. Using this approach, we found that Argonema is actually cosmopolitan in arid regions. It provides further evidence that endemic microbial taxa are likely to be much rarer than expected.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GJ19-12994Y" target="_blank" >GJ19-12994Y: Genomická a geografická diversifikace v průběhu speciace sinic</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Scientific Reports

  • ISSN

    2045-2322

  • e-ISSN

    2045-2322

  • Svazek periodika

    12

  • Číslo periodika v rámci svazku

    MAY

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    "7203-1"-"7203-15"

  • Kód UT WoS článku

    000790397500065

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85129620120