New perspectives of post-GWAS analyses: From markers to causal genes for more precise crop breeding
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F24%3A73628421" target="_blank" >RIV/61989592:15310/24:73628421 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526624001493" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526624001493</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.pbi.2024.102658" target="_blank" >10.1016/j.pbi.2024.102658</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
New perspectives of post-GWAS analyses: From markers to causal genes for more precise crop breeding
Popis výsledku v původním jazyce
Crop breeding advancement is hindered by the imperfection of methods to reveal genes underlying key traits. Genome-wide Association Study (GWAS) is one such method, identifying genomic regions linked to phenotypes. Post-GWAS analyses predict candidate genes and assist in causative mutation (CM) address limitations in omics data integration and stress the importance of evaluating associated variants within a broader context of publicly available datasets. Recent advances in bioinformatics tools and genomic strategies for CM identification and allelic variation exploration are reviewed. We discuss the role of markers and marker panel development for more precise breeding. Finally, we highlight the perspectives and challenges of GWAS-based CM prediction for complex quantitative traits.
Název v anglickém jazyce
New perspectives of post-GWAS analyses: From markers to causal genes for more precise crop breeding
Popis výsledku anglicky
Crop breeding advancement is hindered by the imperfection of methods to reveal genes underlying key traits. Genome-wide Association Study (GWAS) is one such method, identifying genomic regions linked to phenotypes. Post-GWAS analyses predict candidate genes and assist in causative mutation (CM) address limitations in omics data integration and stress the importance of evaluating associated variants within a broader context of publicly available datasets. Recent advances in bioinformatics tools and genomic strategies for CM identification and allelic variation exploration are reviewed. We discuss the role of markers and marker panel development for more precise breeding. Finally, we highlight the perspectives and challenges of GWAS-based CM prediction for complex quantitative traits.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10611 - Plant sciences, botany
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EH22_008%2F0004581" target="_blank" >EH22_008/0004581: Nové poznatky pro plodiny nové generace</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2024
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY
ISSN
1369-5266
e-ISSN
1879-0356
Svazek periodika
82
Číslo periodika v rámci svazku
DEC
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
"102658-1"-"102658-11"
Kód UT WoS článku
001360781900001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85208943082