Sekvenční analýza a ověření aktivity genu pro 4-hydroxyfenylpyruvát dioxygenázu v ječmeni

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F06%3A00099194" target="_blank" >RIV/62156489:43210/06:00099194 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sekvenční analýza a ověření aktivity genu pro 4-hydroxyfenylpyruvát dioxygenázu v ječmeni

Popis výsledku v původním jazyce

U odrůd ječmene jarního s rozdílnou hladinou tokolů (vitamín E) byl studován gen pro 4-hydroxyfenylpyruvát dioxygenázu (HPPD), který je jedním z důležitých enzymů zapojených v biosyntetické dráze tokolů. Z dosavadních experimentů vyplývá, že linie ječmene s odlišným obsahem vitamínu E pravděpodobně nenesou odlišnou či méně funkční alelu tohoto genu. Zatím byl hodnocen délkový polymorfismus u 21 odrůd a 7 šlechtitelských linií. U kontrastních odrůd v obsahu vitamínu E byly navíc provedeny restrikční analýzy specifických produktů. Ukázalo se, že sekvence genu je delší než uváděná sekvence cDNA v GenBank (HVAJ693). Proto jsme přistoupili k sekvenování druhé části genu obsahující intron u odrůd lišících se obsahem tokolů. Část sekvence genu o délce 816 pbobsahovala intron o délce 411 pb v místě, kde ho předpokládali Falk et al. (2002). Na základě přesných hraničních sekvencí tohoto intronu jsme navrhli reverzní primer do místa sestřihu, který bude využit při hodnocení aktivity transkripce

Název v anglickém jazyce

Sequence analysis and activity testing of the gene for 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase in barley

Popis výsledku anglicky

The gene for 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (HPPD) in barley cultivars with different level of tocols (vitamin E) was studied. HPPD is one of the important enzymes involved in the biosynthetic patchway of tocols. Up to now, cultivars with the different vitamin E content do not seem to have any dissimilar or less functional allele of this gene. Till now the length polymorphism of 21 cultivars and 7 lines were evaluated. Moreover, restriction enzyme analyses of specific products were carried out in contrast cultivars with different vitamin E content. The gene sequence was found out to be longer than the published cDNA sequence in GenBank (HVAJ693). Therefore, sequencing of the second part of the gene containing intron was performed. The sequence of816 bp contained 411 bp intron as Falk et al (2002) supposed. The reverse primer in the splicing site was designed based on the the exact exon-intron sequences. This primer will be used for the transcriptional activity analysis of the gen

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/1M0570" target="_blank" >1M0570: Výzkumné centrum pro studium obsahových látek ječmene a chmele</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

MendelNet'06 Agro - sborník z mezinárodní konference posluchačů postgraduálního doktorského studia

ISBN

80-7157-999-8

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

111-111

Název nakladatele

Ediční středisko MZLU v Brně

Místo vydání

MZLU v Brně

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

1. 12. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—