Polymorfizmus mikrosatelitních markerů v kolekci genových zdrojů papriky (Capsicum annuum L.)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F09%3A00156125" target="_blank" >RIV/62156489:43210/09:00156125 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Polymorfizmus mikrosatelitních markerů v kolekci genových zdrojů papriky (Capsicum annuum L.)

Popis výsledku v původním jazyce

V kolekci 41 genových zdrojů papriky (Capsicum annuum L.) byla detekována genetická variabilita pomocí mikrosatelitních markerů. Tři mikrosatelitní markery (Hpms 1-1, Hpms 1-168 a Hpms 1-274) byly uniformní u všech analyzovaných genotypů. Ostatní mikrosatelitní markery poskytovaly od 2 do 8 alel. Celkem bylo detekováno 28 alel, což je v průměru 3,5 alely na jeden mikrosatelitní lokus. Velikost amplifikovaných produktů se pohyboval v rozmezí 172 -- 340 bp. Nejvyšší počet alel byl detekován pomocí primerůHmps 1-5 (8 alel) a Hpms 2-21 (7 alel). Na základě statistického vyhodnocení byl sestaven dendrogram podobnosti. Rozložení analyzovaných genotypů v dendrogramu ukazuje vyšší stupeň podobnosti mezi některými genotypy v kontrastu s jinými genotypy se stejným označením. Molekulární data byla doplněna o morfologický popis podle klasifikátoru pro rod Capsicum. Výsledky ukazují na možnost duplicit v rámci studované kolekce genových zdrojů papriky.

Název v anglickém jazyce

Polymorphism of microsatellite markers in collection of genetic resources of pepper (Capsicum annuum L.)

Popis výsledku anglicky

Within a collection of 41 genetic resources of red pepper genotypes (Capsicum annuum L.) genetic variability using 8 microsatellite markers was tested. Three of the microsatellite markers (Hpms 1-1, Hpms 1-168, and Hpms 1-274) provided uniform spectra inall analyzed genotypes. From 2 to 8 alleles were detected for the rest of microsatellite loci. Totally 28 alleles were detected, which means an average of 3.5 allele per one microsatellite locus. The size of amplified products was determined within thelimits of 172 -- 340 base pairs. The highest number of different alleles was detected using Hpms 1-5 (8 alleles) and Hpms 2-21 primers (7 alleles). Based on statistical evaluation a dendrogram of similarity was constructed. Distribution of the analyzed genotypes in the dendrogram implies a high level of similarity within some genotypes and on the contrary there is a presumption of genetically different material within other genotypes of the same or similar name. Molecular data were compl

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2009

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Acta fytotechnica et zootechnica

ISSN

1336-9245

e-ISSN

—

Svazek periodika

12

Číslo periodika v rámci svazku

Suppl. 1

Stát vydavatele periodika

SK - Slovenská republika

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—