Využití moderních proteomických metod ve výzkumu rostlin

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F10%3A00234818" target="_blank" >RIV/62156489:43210/10:00234818 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://mnet.mendelu.cz/mendelnet2010/mendelnet_2010_fulltext.pdf" target="_blank" >https://mnet.mendelu.cz/mendelnet2010/mendelnet_2010_fulltext.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití moderních proteomických metod ve výzkumu rostlin

Popis výsledku v původním jazyce

Huseníček rolní (Arabidopsis thaliana) je první rostlinou se známou genomovou sekvencí. I dnes, deset let od dokončení sekvenování, patří Arabidopsis mezi nejvíce studované organismy. Zatímco genomová sekvence známá je, mapa proteomu je stále z velké části prázdná. Nejnižší odhady předpokládají, že k přibližně 25 000 genů existuje minimálně 100 000 různých proteinů. Tento téměř řádový rozdíl je způsoben jak alternativním sestřihem genu, kdy jeden gen může mít několik různých produktů-proteinů, tak především post-translačními modifikacemi proteinu. Mezi nejznámější post-translační modifikace patří částečná proteolysa, fosforylace, gylkosylace, ale existuje i celá řada dalších, které byly již v proteinech nalezeny. Post-translační modifikace významně ovlivňují chování daného proteinu (Černý et al., 2010a). Pro samotnou fosforylaci se odhaduje, že minimálně 10-30 % všech proteinů v buňce je fosforylovaných a to třeba i mnohanásobně. Různé modifikace se navíc mohou kombinovat, čímž dramati

Název v anglickém jazyce

Modern proteomics in plant science

Popis výsledku anglicky

Arabidopsis as the first established model plant worldwide belongs among the most intensively studied organism in science. While its entire genome sequence has been available for last ten years, map of Arabidopsis proteome is still mostly blind. It is estimated that there is at least 100, 000 gene products for approximately 25, 000 genes in Arabidopsis genome. However, best proteomic experiments are covering only about 10% of this number. Major problem with uncovering new proteins is their low abundancein the sample. Here we show advantages of modern isolation procedures design to uncover the hidden proteome.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GC - Pěstování rostlin, osevní postupy

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

MendelNet 2010 - Proceedings of International Ph.D. Students Conference

ISBN

978-80-7375-453-2

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

806-809

Název nakladatele

Mendelova univerzita v Brně

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

24. 11. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

341786800103