Stanovení kandidátní sekvence biosyntetické dráhy anthokyanů u pšenice

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F12%3A00190590" target="_blank" >RIV/62156489:43210/12:00190590 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/25328859:_____/12:#0000705

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Stanovení kandidátní sekvence biosyntetické dráhy anthokyanů u pšenice

Popis výsledku v původním jazyce

Anthokyany jsou rostlinné pigmenty, které patří do skupiny flavonoidů. U pšenice (Triticum aestivum L.) se spolupodílejí na rozdílném zbarvení obilky. V této práci jsme se zabývali geny z rané a pozdní biosyntetické dráhy anthokyanů, chalkon izomerázou (CHI) a dihydroflavonol reduktázou (DFR). Jako materiál byly použity zrající obilky jarní formy pšenice s různým zabarvením aleuronu a obalových vrstev. Z obilek byla vyizolována celková RNA a přepsána do cDNA. Při návrhu primerů byly použity sekvence cDNA pro CHI a pro DFR, získané z databáze NCBI. PCR reakcí byly amplifikovány úseky sekvencí pro CHI a DFR, které byly po purifikaci použity pro přímé sekvenování PCR produktu. Získané kandidátní sekvence byly pro vyhodnocení polymorfizmu porovnány se sekvencemi přístupnými v databázi NCBI.

Název v anglickém jazyce

Determination of candidates sequence biosynthetic pathway for anthocyanins in wheat

Popis výsledku anglicky

Anthocyans are plant pigments which belong to the group of flavonoids. They are responsible for different colour caryopsis of common wheat (Triticum aestivum L.). We study the genes from early and later biosynthesis pathway, chalcone isomerase (CHI) anddihydroflavonol reductase (DFR) from late biosynthesis pathway. As a material we used ripened caryopsis of springwheatwith different coloration of the aleurone and pericarp layers. RNA from caryopsis was reverse transcribed into cDNA transcription. For designing primers we used sequences cDNA for CHI and DFR obtained from the database NCBI. PCR reactions were amplified segments of sequences for CHI and DFR, which were used for direct sequencing of PCR product. The obtained candidate sequences were compared with sequences in the NCBI database and it was evaluated their polymorphism.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GD204%2F09%2FH002" target="_blank" >GD204/09/H002: Vývojová biologie a genetika rostlin</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Svazek periodika

—

Číslo periodika v rámci svazku

9

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

183-187

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—