Guidelines for Homology Modeling of Dopamine, Norepinephrine, and Serotonin Transporters
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F16%3A43909787" target="_blank" >RIV/62156489:43210/16:43909787 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216305:26620/16:PU121945
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acschemneuro.6b00242" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/acschemneuro.6b00242</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acschemneuro.6b00242" target="_blank" >10.1021/acschemneuro.6b00242</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Guidelines for Homology Modeling of Dopamine, Norepinephrine, and Serotonin Transporters
Popis výsledku v původním jazyce
The human dopamine, norepinephrine, and serotonin transporters (hDAT, hNET, and hSERT) are carriers of neurotransmitters and targets for many drugs. Pioneering works in the past three years to elucidate experimental models of the Drosophila dDAT and human hSERT structures will rapidly impact the field of neuroscience. Here, we evaluated automated homology-based human models of these transporters, employing systematic physics-based, knowledge-based, and empirical-based check. Modeling guidelines were conveyed with attention to the central binding site (S1), secondary binding site (S2), and the extracellular loops EL2 and EL4. Application of new experimental models (dDAT and hSERT) will improve the accuracy of homology models, previously utilizing prokaryotic leucine transporter (LeuT) structure, and provide better predictions of ligand interactions, which is required for understanding of cellular mechanisms and for development of novel therapeutics.
Název v anglickém jazyce
Guidelines for Homology Modeling of Dopamine, Norepinephrine, and Serotonin Transporters
Popis výsledku anglicky
The human dopamine, norepinephrine, and serotonin transporters (hDAT, hNET, and hSERT) are carriers of neurotransmitters and targets for many drugs. Pioneering works in the past three years to elucidate experimental models of the Drosophila dDAT and human hSERT structures will rapidly impact the field of neuroscience. Here, we evaluated automated homology-based human models of these transporters, employing systematic physics-based, knowledge-based, and empirical-based check. Modeling guidelines were conveyed with attention to the central binding site (S1), secondary binding site (S2), and the extracellular loops EL2 and EL4. Application of new experimental models (dDAT and hSERT) will improve the accuracy of homology models, previously utilizing prokaryotic leucine transporter (LeuT) structure, and provide better predictions of ligand interactions, which is required for understanding of cellular mechanisms and for development of novel therapeutics.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CD - Makromolekulární chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
ACS Chemical Neuroscience
ISSN
1948-7193
e-ISSN
—
Svazek periodika
7
Číslo periodika v rámci svazku
11
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
1607-1613
Kód UT WoS článku
000388433000016
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-84996503994