Aplikace pro srovnání charakteru a barvy endospermu obilovin

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F20%3A43918481" target="_blank" >RIV/62156489:43210/20:43918481 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.utad.cz/wp-content/uploads/2020/11/Volume.zip" target="_blank" >https://www.utad.cz/wp-content/uploads/2020/11/Volume.zip</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Aplikace pro srovnání charakteru a barvy endospermu obilovin

Popis výsledku v původním jazyce

Aplikace umožňuje barevné odlišení endospermu vybraného rodu zrnin na základě sestavených etalonů pro daný druh a odrůdu. Barevné rozlišení je provedeno na dvou úrovních - rozlišení barev ve větším počtu menších čtvercových ROI (region of interest) v základě podobnosti jednotlivých pixelů v RGB prostoru. Výběr ROI pro tvorbu etalonu a počtu i umístění ROI ve zkoumaném vzorku je prováděn v této variantě ručně. Zároveň však umožňuje zkoumání plochy řezu téměř celé obilky na základě barevných skóre, kdy je záměrně použit ROI tvaru úhlové výseče v mezikruží. V tomto režimu software automaticky detekuje polohu obilky v obraze, obsluha může (zejména u nesouměrných obilek) střed ROI modifikovat.

Název v anglickém jazyce

Application for comparing the character and color of cereal endosperm

Popis výsledku anglicky

The application enables color differentiation of the endosperm of a selected genus of grains on the basis of assembled standards for a given species and variety. Color resolution is performed on two levels - color resolution in a number of smaller square ROIs (region of interest) based on the similarity of individual pixels in RGB space. In this variant, the selection of the ROI for the creation of the standard and the number and location of the ROI in the examined sample is performed manually. At the same time, however, it allows examining the cutting area of almost the entire grain on the basis of color scores, when the ROI of the shape of the angular section in the annulus is intentionally used. In this mode, the software automatically detects the position of the grain in the image, the operator can (especially for asymmetrical shapes) modify the center of the ROI.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Srovnání obilek

Technické parametry

Aplikace je vytvořena jako terminálové řešení a distribuována v podobě instalačního balíčku pro PC s operačními systémem Windows (8.1 a vyšší). Pracuje s fotografiemi příčného řezu obilek (Cryo-Cut microtom - American Optical Corp.) z mikroskopu SZH10 (Olympus) ve formátu jpg. Využití vyžaduje proškolenou obsluhu mikroskopu i dané aplikace. Osobou odpovědnou pro jednání ze strany MENDELU je doc. Ing. Martin Fajman, Ph.D., Ústav techniky a automobilové dopravy, Agronomická fakulta, MENDELU, Zemědělská 1, 613 00 Brno, +420 545 133 327.

Ekonomické parametry

Aplikace umožňuje na výzkumné bázi přesnou analýzu barevné škály endospermu obilek (původně rodu Triticum a odlišení tzv. žlutých odrůd s vysokým obsahem karotenoidů). Je však použitelná šířeji, pro odlišení sklovitého a škrobovitého endospermu, popř. jiných barevných variant endospermu. Distribuována je plnohodnotná verze softwaru.

IČO vlastníka výsledku

62156489

Název vlastníka

Mendelova univerzita v Brně