Pou?ití SSR markerů pro identifikaci odrůd révy registrovaných v České republice
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F06%3A00094517" target="_blank" >RIV/62156489:43510/06:00094517 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Use of SSR markers to identify grapevine cultivars registered in the Czech republic
Popis výsledku v původním jazyce
In this study we analyzed 51 grapevine cultivars registered in the Czech Republic using six highly informative SSR loci, and determined SSR profiles typical for each cultivar. All cultivars were easily distinguished on the basis of SSR allele length, except for berry color mutants (Pinot and Chasselas group). The average number of detected alleles per locus was 13.2, while observed heterozygosity is between 0.745 (VrZAG 79) and 0.922 (VVMD 7). The lengths of the alleles were compared with results from other laboratories; lengths were either the same or different by 1-3 bp. We also tested a new approach to microsatellite data comparison using a coding system based on reference alleles as a size standard (THIS et al., 2004). The obtained profiles were mostly in accordance with profiles of reference cultivars (THIS et al., 2004); we discuss the possible reasons for observed discrepancies. A third allele in the microsatellite spectrum was observed in five samples where template DNA origina
Název v anglickém jazyce
Use of SSR markers to identify grapevine cultivars registered in the Czech republic
Popis výsledku anglicky
In this study we analyzed 51 grapevine cultivars registered in the Czech Republic using six highly informative SSR loci, and determined SSR profiles typical for each cultivar. All cultivars were easily distinguished on the basis of SSR allele length, except for berry color mutants (Pinot and Chasselas group). The average number of detected alleles per locus was 13.2, while observed heterozygosity is between 0.745 (VrZAG 79) and 0.922 (VVMD 7). The lengths of the alleles were compared with results from other laboratories; lengths were either the same or different by 1-3 bp. We also tested a new approach to microsatellite data comparison using a coding system based on reference alleles as a size standard (THIS et al., 2004). The obtained profiles were mostly in accordance with profiles of reference cultivars (THIS et al., 2004); we discuss the possible reasons for observed discrepancies. A third allele in the microsatellite spectrum was observed in five samples where template DNA origina
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QC1156" target="_blank" >QC1156: Vytvoření alternativní metodiky identifikace odrůd révy vinné založené na zhodnocení rozdílností ve struktuře DNA u jednotlivých odrůd.</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2006
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International journal of vine and wine sciences
ISSN
1151-0285
e-ISSN
—
Svazek periodika
—
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
FR - Francouzská republika
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
2
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—