Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Comparative Genomics Identifies Conserved and Variable TAL Effectors in African Strains of the Cotton Pathogen Xanthomonas citri pv. malvacearum

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F23%3A43924086" target="_blank" >RIV/62156489:43510/23:43924086 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-22-0477-SC" target="_blank" >https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-22-0477-SC</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1094/PHYTO-12-22-0477-SC" target="_blank" >10.1094/PHYTO-12-22-0477-SC</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Comparative Genomics Identifies Conserved and Variable TAL Effectors in African Strains of the Cotton Pathogen Xanthomonas citri pv. malvacearum

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Strains of Xanthomonas citri pv. malvacearum cause bacterial blight of cotton, a potentially serious threat to cotton production worldwide, including in sub-Saharan countries. Development of disease symptoms, such as water soaking, has been linked to the activity of a class of type 3 effectors, called transcription activator-like (TAL) effectors, which induce susceptibility genes in the host&apos;s cells. To gain further insight into the global diversity of the pathogen, to elucidate their repertoires of TAL effector genes, and to better understand the evolution of these genes in the cotton-pathogenic xanthomonads, we sequenced the genomes of three African strains of X. citri pv. malvacearum using nanopore technology. We show that the cotton-pathogenic pathovar of X. citri is a monophyletic lineage containing at least three distinct genetic subclades, which appear to be mirrored by their repertoires of TAL effectors. We observed an atypical level of TAL effector gene pseudogenization, which might be related to resistance genes that are deployed to control the disease. Our work thus contributes to a better understanding of the conservation and importance of TAL effectors in the interaction with the host plant, which can inform strategies for improving resistance against bacterial blight in cotton.

  • Název v anglickém jazyce

    Comparative Genomics Identifies Conserved and Variable TAL Effectors in African Strains of the Cotton Pathogen Xanthomonas citri pv. malvacearum

  • Popis výsledku anglicky

    Strains of Xanthomonas citri pv. malvacearum cause bacterial blight of cotton, a potentially serious threat to cotton production worldwide, including in sub-Saharan countries. Development of disease symptoms, such as water soaking, has been linked to the activity of a class of type 3 effectors, called transcription activator-like (TAL) effectors, which induce susceptibility genes in the host&apos;s cells. To gain further insight into the global diversity of the pathogen, to elucidate their repertoires of TAL effector genes, and to better understand the evolution of these genes in the cotton-pathogenic xanthomonads, we sequenced the genomes of three African strains of X. citri pv. malvacearum using nanopore technology. We show that the cotton-pathogenic pathovar of X. citri is a monophyletic lineage containing at least three distinct genetic subclades, which appear to be mirrored by their repertoires of TAL effectors. We observed an atypical level of TAL effector gene pseudogenization, which might be related to resistance genes that are deployed to control the disease. Our work thus contributes to a better understanding of the conservation and importance of TAL effectors in the interaction with the host plant, which can inform strategies for improving resistance against bacterial blight in cotton.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Phytopathology

  • ISSN

    0031-949X

  • e-ISSN

    1943-7684

  • Svazek periodika

    113

  • Číslo periodika v rámci svazku

    8

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    7

  • Strana od-do

    1387-1393

  • Kód UT WoS článku

    001070752700001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85174961141