Polymorphism analysis and mapping to SSC4 of the porcine apolipoprotein A2 (APOA2) gene

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A_____%2F03%3A23300003" target="_blank" >RIV/62156489:_____/03:23300003 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/67985904:_____/03:21033029

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Polymorphism analysis and mapping to SSC4 of the porcine apolipoprotein A2 (APOA2) gene

Popis výsledku v původním jazyce

Three SNPs within intron 3 were found by direct sequencing of the porcine PCR products of ~800 bp. Two of these SNPs can be detected by PCR-RFLP using Eco47III and XmaJI. The polymorphic composite microsatellite (SCZ001) with tetranucleotide repeat region was found in intron 3. We described a total of 15 different alleles differing in length. All fragment were sequenced and sequences have been deposited in the EMBL database. Allele frequencies in unrelated pigs of different breeds are presented Linkagemapping of APOA2 in the Hohenheim M x P pedigree was accomplished using the SCZ001 polymorphism. The APOA2 gene was localized to chromosome 4 and a partial linkage map is: V-ATPase-5.3-ATP1B1-4.2-SDHC-0.2-APOA2-1.3-CASQ1-1.3-ATP1A -0.0-MEF2D. Using radiation hybrid mapping (IMpRH), APOA2 was assigned to chromosome 4, between markers SW1364 and SW589.

Název v anglickém jazyce

Polymorphism analysis and mapping to SSC4 of the porcine apolipoprotein A2 (APOA2) gene

Popis výsledku anglicky

Three SNPs within intron 3 were found by direct sequencing of the porcine PCR products of ~800 bp. Two of these SNPs can be detected by PCR-RFLP using Eco47III and XmaJI. The polymorphic composite microsatellite (SCZ001) with tetranucleotide repeat region was found in intron 3. We described a total of 15 different alleles differing in length. All fragment were sequenced and sequences have been deposited in the EMBL database. Allele frequencies in unrelated pigs of different breeds are presented Linkagemapping of APOA2 in the Hohenheim M x P pedigree was accomplished using the SCZ001 polymorphism. The APOA2 gene was localized to chromosome 4 and a partial linkage map is: V-ATPase-5.3-ATP1B1-4.2-SDHC-0.2-APOA2-1.3-CASQ1-1.3-ATP1A -0.0-MEF2D. Using radiation hybrid mapping (IMpRH), APOA2 was assigned to chromosome 4, between markers SW1364 and SW589.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Animal Genetics

ISSN

0268-9146

e-ISSN

—

Svazek periodika

34

Číslo periodika v rámci svazku

5

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

384-386

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—