Development of Multilocus Sequence Tool for typing Cryptosporidium muris and Cryptosporidium andersoni
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F11%3A43870237" target="_blank" >RIV/62157124:16170/11:43870237 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1128/JCM.01329-10" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1128/JCM.01329-10</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1128/JCM.01329-10" target="_blank" >10.1128/JCM.01329-10</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Development of Multilocus Sequence Tool for typing Cryptosporidium muris and Cryptosporidium andersoni
Popis výsledku v původním jazyce
Although widely used for the characterization of the transmission of intestinal Cryptosporidium spp., genotyping tools are not available for C. muris and C. andersoni, two of the most common gastric Cryptosporidium spp. infecting mammals. In this study,we screened the C. muris whole-genome sequencing data for microsatellite and minisatellite sequences. Among the 13 potential loci (6 microsatellite and 7 minisatellite loci) evaluated by PCR and DNA sequencing, 4 were eventually chosen. DNA sequence analyses of 27 C. muris and 17 C. andersoni DNA preparations showed the presence of 5 to 10 subtypes of C. muris and 1 to 4 subtypes of C. andersoni at each locus. Altogether, 11 C. muris and 7 C. andersoni multilocus sequence typing (MLST) subtypes were detected among the 16 C. muris and 12 C. andersoni specimens successfully sequenced at all four loci. In all analyses, the C. muris isolate (TS03) that originated from an East African mole rat differed significantly from other C. muris isola
Název v anglickém jazyce
Development of Multilocus Sequence Tool for typing Cryptosporidium muris and Cryptosporidium andersoni
Popis výsledku anglicky
Although widely used for the characterization of the transmission of intestinal Cryptosporidium spp., genotyping tools are not available for C. muris and C. andersoni, two of the most common gastric Cryptosporidium spp. infecting mammals. In this study,we screened the C. muris whole-genome sequencing data for microsatellite and minisatellite sequences. Among the 13 potential loci (6 microsatellite and 7 minisatellite loci) evaluated by PCR and DNA sequencing, 4 were eventually chosen. DNA sequence analyses of 27 C. muris and 17 C. andersoni DNA preparations showed the presence of 5 to 10 subtypes of C. muris and 1 to 4 subtypes of C. andersoni at each locus. Altogether, 11 C. muris and 7 C. andersoni multilocus sequence typing (MLST) subtypes were detected among the 16 C. muris and 12 C. andersoni specimens successfully sequenced at all four loci. In all analyses, the C. muris isolate (TS03) that originated from an East African mole rat differed significantly from other C. muris isola
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
N - Vyzkumna aktivita podporovana z neverejnych zdroju
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of clinical microbiology
ISSN
0095-1137
e-ISSN
—
Svazek periodika
49
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
34-41
Kód UT WoS článku
000285787100003
EID výsledku v databázi Scopus
—