Výskyt a fylogenetická analýza parvovirů afrických primátů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F14%3A43873130" target="_blank" >RIV/62157124:16170/14:43873130 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Výskyt a fylogenetická analýza parvovirů afrických primátů

Popis výsledku v původním jazyce

Parvoviry jsou malé neobalené viry patřící do čeledi Parvoviridae, jejichž genom tvoří jednořetězcová molekula DNA o velikosti kolem 5000 nt. Zástupci této čeledi tvoří velmi rozmanitou skupinu a mohou infikovat primáty i člověka. Přítomnost parvovirů byla zkoumána na souboru vzorků trusu afrických primátů. Pomocí nested PCR byly amplifikovány konzervované oblasti NS genu. Amplifikované fragmenty byly sekvenovány, získané sekvence byly porovnány s dostupnými sekvencemi v databázi GenBank. Ze vzorků trusu získaných ze zoologických zahrad byla prokázána DNA bokavirů pouze u jedné samice šimpanze z celkových 150 vzorků afrických primátů. Ve vzorcích trusu divoce žijících šimpanzů byla detekována přítomnost DNA bokavirů pouze ve 13 případech z celkových 113 vzorků. DNA PARV4 byla zjištěna pouze u jednoho divoce žijícího zvířete.

Název v anglickém jazyce

Phylogenetic analysis of parvoviruses infecting African primates

Popis výsledku anglicky

Parvoviruses are small no-enveloped viruses which belong to the Parvoviridae family. Its genome is formed by ssDNA of 5000 nt in length. Members of the Parvoviridae family form a diverse group of viruses infecting both human and non-human primates. The presence of parvovirus DNA in a set of African primate fecal samples was PCR tested using primers targeted in the most conserved part of NS gene. The amplified fragments were sequenced; the identity of obtained sequences was confirmed by comparison with already published sequences. Bocaviruses were detected in one captive living female chimpanzee (1/150) and 13 wild living chimpanzees (13/113). PARV4 DNA was detected only in one wild living chimpanzee sample.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ED1.1.00%2F02.0068" target="_blank" >ED1.1.00/02.0068: CEITEC - central european institute of technology</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Čo nového v mikrobiológii

ISBN

978-80-971422-1-6

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

11-16

Název nakladatele

Československá spoločnosť mikrobiologická

Místo vydání

Univerzita UK v Bratislavě, Slovensko

Místo konání akce

Štrbské Pleso, Slovensko

Datum konání akce

13. 2. 2014

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—