Porovnání výsledku mikrobiologické kultivace a PCR detekce patogenů v tělních tekutinách septických hříbat.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F19%3A43878165" target="_blank" >RIV/62157124:16170/19:43878165 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vfu.cz/files/Sbornik_IGA_2019.pdf" target="_blank" >https://www.vfu.cz/files/Sbornik_IGA_2019.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Porovnání výsledku mikrobiologické kultivace a PCR detekce patogenů v tělních tekutinách septických hříbat.

Popis výsledku v původním jazyce

Na základě modifikovaného systému hodnocení neonatální sepse dle Wonga et al. (2018) bylo do studie zahrnuto celkem 15 septických hříbat, z toho 9 hříbat trpělo současně septickou artritidou jednoho nebo více kloubů. U všech septických hříbat bylo sterilně odebráno 20 ml venózní krve pro hemokultivaci a PCR pandetekci patogenů, u hříbat s postižením kloubů byl perkutánní sterilní aspirací získán vzorek synovie. Krev na hemokultivaci byla umístěna do kultivačního média pro aeroby a anaeroby, vzorek synovie poté do sterilní zkumavky. Hemokultivace / kultivace synovie probíhala ve veterinární laboratoři Laboklin GMBH Co.&amp;KG. Vzorek plné krve / synovie pro detekci PCR byl vyšetřen v Tilia Laboratories s.r.o. Z odebraného biologického materiálu byla následně izolována celková nukleová kyselina. Byla provedena PCR amplifikace 16S rDNA s následným přímým sekvenováním PCR produktů na kapilárním sekvenátoru ABI3500.

Název v anglickém jazyce

The comparison of microbiological cultivation and PCR pathogen detection in body fluids of neonatal septicemic foals.

Popis výsledku anglicky

Based on modified septic system scoring (Wong et al. 2018), 15 septic foals were included in this study. Nine of them were diagnosed with septic arthritis of one or more joints consequently. 20 ml of venous blood was aseptically taken from jugular vein of each foal for blood culture and PCR pathogen detection. In foals with affected joints, synovial fluid was sampled and submitted for microbiological cultivation and PCR detection. Blood culture and synovial fluid cultivation was performed at veterinary laboratory Laboklin GMBH Co.&amp;KG. To detect the major bacterial agent, direct 16S rDNA Sanger sequencing was performed. Total DNA was isolated using a Qiagen DNA mini kit (Qiagen, DE) from from the sampled biological material, according to the recommendation of the manufacturer. DNA was subjected to end-point PCR amplification of the V5 to V8 portion of 16S rDNA gene. The obtained PCR products were directly sequenced on an ABI 3500 genetic analyser (Applied Biosystems, USA)

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Konference Interní grantové agentury VFU Brno

ISBN

978-80-7305-830-2

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

27-30

Název nakladatele

Veterinární a farmaceutická univerzita Brno

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

10. 12. 2019

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—