Analýza genomu E. coli z drůbeže odhalila významné klonální linie

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F21%3A43879291" target="_blank" >RIV/62157124:16170/21:43879291 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vetweb.cz/" target="_blank" >https://vetweb.cz/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Analýza genomu E. coli z drůbeže odhalila významné klonální linie

Popis výsledku v původním jazyce

Kolibacilóza drůbeže je komplexní onemocnění, zahrnující několik různých syndromů, které způsobují masivní ztráty u všech kategorií kura domácího na všech úrovních produkčního řetězce. Rozporuplné chápání původce tohoto onemocnění je hlavní překážkou v tvorbě efektivních preventivních opatření, které by zamezily jak ztrátám, tak spotřebě antibiotik. E. coli patogenní pro ptáky (APEC) je variabilním patotypem, jejž nelze definovat jediným charakteristickým znakem. Komparativní genomika s použitím celogenomového sekvenování ukazuje, že koncept APEC jako epidemicky se vyskytujících klonálních linií, přenášených produkčním řetězcem, může být výchozí bodem pro monitoring a diagnostické a intervenční strategie ke snížení prevalence těchto linií v chovech. První pokus uplatnit tento druh analýzy na izoláty z českých chovů odhalil hned několik potenciálně rizikových linií včetně sekvenčních typů ST117 a ST95.

Název v anglickém jazyce

Genomic analysis of E. coli from poultry revealed several important clonal lineages

Popis výsledku anglicky

Colibacillosis of poultry is a complex disease, comprising of several distinct syndromes, which cause massive losses in all production cathegories and on all levels of the poultry production chain. Contradictions in the way we understand the agent of this disease are the main obstacle in conceiving effective measures to prevent both losses and consumption of antimicrobials. Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) is a variable pathotype, undefineable by a single characteristic. Comparative genomic studies using whole genome sequencing show the concept of APEC as epidemic clonal lineages, transmitted throughout the production chain, to be an adequate base for monitoring, diagnostic a and intervention strategies to reduce the prevalence of these lineages on production farms. The first attempt to apply this kind of analysis on isolates from Czech farms revealed several potentially risk lineages including sequence types ST117 and ST95.

Druh

J_ost - Ostatní články v recenzovaných periodicích

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QK1810462" target="_blank" >QK1810462: Manipulace se složením střevní mikroflóry monogastrů jako cesta k potlačení E. coli infekcí a snížení spotřeby antimikrobik</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Veterinářství

ISSN

0506-8231

e-ISSN

—

Svazek periodika

71

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

201-205

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—