C-type Lectine protein viru Afrického moru prasat

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F22%3A43880274" target="_blank" >RIV/62157124:16170/22:43880274 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

C-type Lectine protein viru Afrického moru prasat

Popis výsledku v původním jazyce

Virus afrického moru prasat, rod Asfivirus z čeledi Asfarviridae, je cytoplazmatický, lineární, obalený dsDNA virus přenášený vektorem, který postihuje všechny členy čeledi Suideae. K prevenci infekce zatím neexistuje vakcína, částečně v důsledku neznámé funkce většiny virových proteinů. C-type lectin protein je jedním z kandidátů na proteiny s imunogenní funkcí. Cílem práce byla identifikace antigenních oblastí ve struktuře C-type lectin proteinu a to porovnáním in-silico a pepscan analýzy tohoto proteinu. Oblasti proteinu s antigenními vlastnostmi byly identifikovány in silico analýzou (programem dostupným v Immune Epitope Database). Dále byly navrženy a nasyntetizovány peptidy pokrývající celou délku C-type lectin proteinu. Jejich sérologická reaktivita byla testována na souboru sér prasat pozitivních na virus afrického moru prasat. Korelace mezi in-silico identifikovánými B-buněčnými epitopy a syntetickými peptidy byla identifikována u většiny peptidů. Byly zjištěny domény obsahující potenciální B-buněčné epitopy ve struktuře C-type lectin proteinu. Dle našich experimentů se C-type lectin protein zdá být vhodným kandidátem nejen na protein s významem v sérologické diagnostice viru, ale i na subjednotkovou vakcínu proti Africkému moru prasat.

Název v anglickém jazyce

C-type Lectine protein of African swine fever virus

Popis výsledku anglicky

African swine fever virus, genus Asfivirus of the family Asfarviridae, is a vector-borne, cytoplasmic, linear, enveloped dsDNA virus that affects all members of the family Suideae. There is no vaccine yet to prevent infection, in part due to the unknown function of most viral proteins. C-type lectin protein is one of the candidates for proteins with immunogenic function. The aim of the work was to identify antigenic regions in the structure of C-type lectin protein by comparing in-silico and pepscan analysis of this protein. Regions of the protein with antigenic properties were identified by in silico analysis (a program available in the Immune Epitope Database). Furthermore, peptides covering the entire length of the C-type lectin protein were designed and synthesized. Their serological reactivity was tested on a set of pig sera positive for the African swine fever virus. Correlation between in-silico identified B-cell epitopes and synthetic peptides was identified for most peptides. Domains containing potential B-cell epitopes were identified in the structure of the C-type lectin protein. According to our experiments, the C-type lectin protein seems to be a suitable candidate not only for a protein with significance in the serological diagnosis of the virus, but also for a subunit vaccine against African swine fever.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů