Phylogenetic position of Pelusios williamsi and a critique of current GenBank procedures (Reptilia: Testudines: Pelomedusidae)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F12%3A43871579" target="_blank" >RIV/62157124:16270/12:43871579 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1163/156853812X627204" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1163/156853812X627204</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1163/156853812X627204" target="_blank" >10.1163/156853812X627204</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Phylogenetic position of Pelusios williamsi and a critique of current GenBank procedures (Reptilia: Testudines: Pelomedusidae)
Popis výsledku v původním jazyce
We re-examine the phylogenetic position of Pelusios williamsi by merging new sequences with an earlier published data set for all Pelusios species, except the possibly extinct P. seychellensis, and the nine previously identified lineages of the closely allied genus Pelomedusa (2054 bp mtDNA, 2025 bp nDNA). Furthermore, we include new sequences of P. broadleyi, P. castanoides, P. gabonensis and P. marani. Individual and combined Maximum Likelihood analyses of the mitochondrial and nuclear data sets indicate that P. williamsi is sister to P. castanoides, as predicted by morphology. This provides evidence for the misidentification of GenBank sequences allegedly representing P. williamsi. Such mislabelled GenBank sequences contribute to continued confusion, because only the original submitter can revise their identification; an impractical procedure impeding the rectification of obvious mistakes. Furthermore, using uncorrected p distances of the mitochondrial cytochrome b gene as a yardsti
Název v anglickém jazyce
Phylogenetic position of Pelusios williamsi and a critique of current GenBank procedures (Reptilia: Testudines: Pelomedusidae)
Popis výsledku anglicky
We re-examine the phylogenetic position of Pelusios williamsi by merging new sequences with an earlier published data set for all Pelusios species, except the possibly extinct P. seychellensis, and the nine previously identified lineages of the closely allied genus Pelomedusa (2054 bp mtDNA, 2025 bp nDNA). Furthermore, we include new sequences of P. broadleyi, P. castanoides, P. gabonensis and P. marani. Individual and combined Maximum Likelihood analyses of the mitochondrial and nuclear data sets indicate that P. williamsi is sister to P. castanoides, as predicted by morphology. This provides evidence for the misidentification of GenBank sequences allegedly representing P. williamsi. Such mislabelled GenBank sequences contribute to continued confusion, because only the original submitter can revise their identification; an impractical procedure impeding the rectification of obvious mistakes. Furthermore, using uncorrected p distances of the mitochondrial cytochrome b gene as a yardsti
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EG - Zoologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Amphibia-Reptilia
ISSN
0173-5373
e-ISSN
—
Svazek periodika
33
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
150-154
Kód UT WoS článku
000302130300015
EID výsledku v databázi Scopus
—