Analysis of the full G gene sequence of the viral haemorrhagic septicaemia virus isolate from the Czech Republic

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F17%3A43875621" target="_blank" >RIV/62157124:16270/17:43875621 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Analysis of the full G gene sequence of the viral haemorrhagic septicaemia virus isolate from the Czech Republic

Popis výsledku v původním jazyce

Production of salmonids in the high-capacity fish farms is the fastest growing fish-related industry in the Czech Republic. The virological pathogen with the most severe economical impact in these establishments is the viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV). High genetic variability of this RNA virus from the family Rhabdoviridae could be used in molecular epidemiology. Presented study focuses on a VHS outbreak in the Vysočina region from the autumn of 2016. Clinical signs of the disease and the means of isolation and detection of the virus responsible are described. The genetic analysis of the isolate will be provided, using the full glycoprotein gene sequencing; classifying it into VHSV genotype I class Ia. This Czech isolate is compared with sequences available in the GenBank database, with emphasis on isolates from countries with high fish-trade rates with the Czech Republic, looking for a possible trade-related spread of the virus.

Název v anglickém jazyce

Analysis of the full G gene sequence of the viral haemorrhagic septicaemia virus isolate from the Czech Republic

Popis výsledku anglicky

Production of salmonids in the high-capacity fish farms is the fastest growing fish-related industry in the Czech Republic. The virological pathogen with the most severe economical impact in these establishments is the viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV). High genetic variability of this RNA virus from the family Rhabdoviridae could be used in molecular epidemiology. Presented study focuses on a VHS outbreak in the Vysočina region from the autumn of 2016. Clinical signs of the disease and the means of isolation and detection of the virus responsible are described. The genetic analysis of the isolate will be provided, using the full glycoprotein gene sequencing; classifying it into VHSV genotype I class Ia. This Czech isolate is compared with sequences available in the GenBank database, with emphasis on isolates from countries with high fish-trade rates with the Czech Republic, looking for a possible trade-related spread of the virus.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1510077" target="_blank" >QJ1510077: Zvýšení a zefektivnění produkce lososovitých ryb v ČR s využitím jejich genetické identifikace.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

XIX. KONFERENCE MLADÝCH VĚDECKÝCH PRACOVNÍKŮ S MEZINÁRODNÍ ÚČASTÍ Sborník příspěvků

ISBN

978-80-7305-788-6

ISSN

—

e-ISSN

neuvedeno

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

83-85

Název nakladatele

Veterinární a farmaceutická univerzita Brno

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

24. 5. 2017

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—