Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Detection of clinically important beta-lactamases by using PCR

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16810%2F21%3A43879646" target="_blank" >RIV/62157124:16810/21:43879646 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/62157124:16270/21:43879646

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/femsle/article-abstract/368/11/fnab068/6294906?redirectedFrom=fulltext" target="_blank" >https://academic.oup.com/femsle/article-abstract/368/11/fnab068/6294906?redirectedFrom=fulltext</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/femsle/fnab068" target="_blank" >10.1093/femsle/fnab068</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Detection of clinically important beta-lactamases by using PCR

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Increasing antimicrobial resistance of nosocomial pathogens is becoming a serious threat to public health. To control the spread of this resistance, it is necessary to detect beta-lactamase-producing organisms in the clinical setting. The aims of the study were to design a PCR assay for rapid detection of clinically encountered beta-lactamase genes described in Enterobacteriaceae and Gram-negative non-fermenting bacteria. The functionality of proposed primers was verified using eight reference strains and 17 strains from our collection, which contained 29 different beta-lactamase genes. PCR products of the test strains were confirmed by Sanger sequencing. Sequence analysis was performed using bioinformatics software Geneious. Overall, 67 pairs of primers for detecting 12 members of the class C beta-lactamase family, 15 members of class A beta-lactamases, six gene families of subclass B1, one member each of subclasses B2, B3 and class D beta-lactamases were designed, of which 43 pairs were experimentally tested in vitro. All 29 beta-lactamase genes, including 10 oxacillinase subgroups, were correctly identified by PCR. The proposed set of primers should be able to specifically detect 99.7% of analyzed beta-lactamase subtypes and more than 79.8% of all described beta-lactamase genes.

  • Název v anglickém jazyce

    Detection of clinically important beta-lactamases by using PCR

  • Popis výsledku anglicky

    Increasing antimicrobial resistance of nosocomial pathogens is becoming a serious threat to public health. To control the spread of this resistance, it is necessary to detect beta-lactamase-producing organisms in the clinical setting. The aims of the study were to design a PCR assay for rapid detection of clinically encountered beta-lactamase genes described in Enterobacteriaceae and Gram-negative non-fermenting bacteria. The functionality of proposed primers was verified using eight reference strains and 17 strains from our collection, which contained 29 different beta-lactamase genes. PCR products of the test strains were confirmed by Sanger sequencing. Sequence analysis was performed using bioinformatics software Geneious. Overall, 67 pairs of primers for detecting 12 members of the class C beta-lactamase family, 15 members of class A beta-lactamases, six gene families of subclass B1, one member each of subclasses B2, B3 and class D beta-lactamases were designed, of which 43 pairs were experimentally tested in vitro. All 29 beta-lactamase genes, including 10 oxacillinase subgroups, were correctly identified by PCR. The proposed set of primers should be able to specifically detect 99.7% of analyzed beta-lactamase subtypes and more than 79.8% of all described beta-lactamase genes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Fems microbiology letters

  • ISSN

    0378-1097

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    368

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000670887100004

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85108386470