Ověřený technologický postup přípravy vzorků nádoru kolorekta pro NGS zařízení

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F63078180%3A_____%2F17%3AN0000003" target="_blank" >RIV/63078180:_____/17:N0000003 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.vuab.cz" target="_blank" >http://www.vuab.cz</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Ověřený technologický postup přípravy vzorků nádoru kolorekta pro NGS zařízení

Popis výsledku v původním jazyce

Ověřená technologie popisuje postup přípravy knihovny vzorků vhodné kvality pro sekvenování nové generace (NGS) na přístoji Illumina MiSeq ze vzorků nádorové tkáně v parafínovém bločku (FFPE). Tento postup zahrnuje definici parametrů pro vstupní vzorek, jeho zpracování vhodnou izolační metodou. Definuje postupy pro kontrolu kvality vstupní DNA, popisuje způsob amplifikace, ředění a teplotního profilu PCR pro získání dostatečně kvalitní a koncentrované knihovny vzorků. Dále technologie popisuje způsob inkorporace indexů a adaptorů a podmínky purifikace vedoucí k získání konečné knihovny DNA pro aplikaci do přístroje MiSeq.

Název v anglickém jazyce

Technological process for preparation of colorectal cancer samples for Next generation sequencing

Popis výsledku anglicky

This technological process describes the preparation of genetic library for next generation sequencing. The technology is intended for Illumina MiSeq instrument from Formalin-Fixed Paraffin-Embedded tissue samples (FFPE samples). This process includes input requirements for samples and process of izolation of DNA from FFPE samples. It also defines process of quality control of input DNA, conditions for dilution, amplification and temperature profile of PCR which ensure the prepatation of genetic library with good quality and concentration. Further the technological process describes the how to incorporate barr codes and adaptors and how to purified the library for final aplication into the MiSeq instrument.

Druh

Z_tech - Ověřená technologie

CEP obor

—

OECD FORD obor

30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])

Projekt

<a href="/cs/project/TA04010838" target="_blank" >TA04010838: Diagnostika nádorových onemocnění s podporou Next Generation Sequencing</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Interní identifikační kód produktu

TA04010838V003

Číselná identifikace

2014TA04010838

Technické parametry

Technologický postup s definovanými kontrolními body a pro použití společně s diagnostickými kity pro NGS

Ekonomické parametry

Ekonomické přínosy se předpokládají v souvislosti s prodejem výsledku Prototyp. VUAB Pharma a.s. plánuje výsledek využít k vývoji dalších kitů pro jiná onkologická onemocnění (melanom, detekce mikrosatelitní instability) ve spolupráci s klinickými a výzkumnými pracovišti v rámci dalších grantových či negrantových projektů.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

63078180

Název vlastníka

VUAB Pharma a.s.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

V - Výsledek je využíván vlastníkem

Požadavek na licenční poplatek

—

Adresa www stránky s výsledkem

www.vuab.cz