Prototyp soupravy pro kvantifikaci exprese vybraného genu, PNPLA3

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F64578895%3A_____%2F20%3AN0000001" target="_blank" >RIV/64578895:_____/20:N0000001 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Prototyp soupravy pro kvantifikaci exprese vybraného genu, PNPLA3

Popis výsledku v původním jazyce

V rámci tohoto projektu byla vyvinuta nová zjednodušená metoda pro kvantifikaci exprese PNPLA3 genu. Metoda spočívá ve vazbě specifických DNA oligonukleotidových sond na templátovou RNA pro PNPLA3, ligaci DNA sond vázaných na PNPLA3 RNA pomocí DNA ligázy a následné aplifikaci ligovaných úseků DNA pomocí qPCR. Byly vyvinuty pufrované roztoky s aditivy, které umožňují provést hybridizaci, ligaci i qPCR v jedné zkumavce. Tato metoda byla využita pro přípravu prototypu soupravu na stanovení PNPLA3 mRNA. Souprava obsahuje všechny komponenty nutné pro kvantifikaci PNPLA3 z izolované RNA, včetně specifických oligonukleotidových primerů, ligaci a amplifikaci ligovaných fragmentů pomocí qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1.

Název v anglickém jazyce

Prototype of the kit for quantification of the selected gene expression, PNPLA3

Popis výsledku anglicky

Within this project, a new simplified method for quantification of PNPLA3 gene expression was developed. This method consists of binding specific DNA oligonucleotide probes with template RNA for PNPLA3, ligating DNA probes bound to PNPLA3 RNA by DNA ligase, and then amplifying the ligated DNA segments with qPCR. Buffered solutions with additives have been developed that allow hybridization, ligation and qPCR to be performed in a single tube. A kit for the determination of PNPLA3 has been designed. This kit contains all the necessary components for the quantification of PNPLA3 from isolated RNA, including specific oligonucleotide primers, enzymes needed for ligation and amplification of ligated fragments by qPCR using SYBR Green 1 intercalation dye.

Druh

G_prot - Prototyp

CEP obor

—

OECD FORD obor

30101 - Human genetics

Projekt

<a href="/cs/project/FV20479" target="_blank" >FV20479: Zjednodušená metoda kvantifikace exprese specifických genů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

R-qPCR_PNPLA3_WT-SYBR

Číselná identifikace

—

Technické parametry

Jedná se o soupravu pro stanovení mRNA pro PNPLA3 WT: Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem, 3) DNA ligázu (SplintR) a 4) DNA sondy L a R. Jedná se o dva syntetické oligonukleotidy DNA, jejichž sekvence jsou komplementární ke stanovované mRNA a navazují bezprostředně na sebe. Sekvence každé sondy na jednom konci pokračuje sekvencí pro nasedání primerů pro qPCR detekci. Tyto amplifikační primery jsou rovněž součástí soupravy. Souprava bude vyráběna ve společnosti Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, které se podílelo na řešení projektu, případně bude po udělení podaného patentu, nabídnuta na licenčním základě zájemcům.

Ekonomické parametry

Jedná se o stanovení unikátní PNPLA3 mRNA s využitím až stovek souprav ročně na domácím trhu se ziskem z domácího trhu v jednotkách stovek tisíc Kč.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

64578895

Název vlastníka

Top-Bio, s.r.o., Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

Z - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje v některých případech licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

—