Prototyp univerzálně použitelné soupravy pro kvantifikaci genové exprese na bazi hybridizačních sond

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F64578895%3A_____%2F20%3AN0000004" target="_blank" >RIV/64578895:_____/20:N0000004 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Prototyp univerzálně použitelné soupravy pro kvantifikaci genové exprese na bazi hybridizačních sond

Popis výsledku v původním jazyce

V rámci projektu MPO TRIO byla vyvinuta nová zjednodušená univerzální metoda pro kvantifikaci exprese genů. Metoda spočívá ve vazbě specifických DNA oligonukleotidových sond na templátovou RNA, ligaci DNA sond vázaných na mRNA pomocí DNA ligázy a následné aplifikaci ligovaných úseků DNA pomocí qPCR. Byly vyvinuty pufrované roztoky s aditivy, které umožňují provést hybridizaci, ligaci i qPCR v jedné zkumavce. Tato metoda byla využita pro přípravu prototypu univerzální soupravu mRNA. Souprava obsahuje všechny komponenty nutné pro kvantifikaci vybrané mRNA, včetně návodu na navržení specifických oligonukleotidových sodn, ligaci a amplifikaci ligovaných fragmentů pomocí qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1. Dvojice oligonukleotidových sond specifických pro uživatelem zvolenou mRNA, amplifikační DNA primery a hydrolyzační próby nejsou součástí soupravy.

Název v anglickém jazyce

Prototype of a universally applicable kit for quantification of gene expression with hydrolysis probe

Popis výsledku anglicky

Within this project, a new simplified method for quantification of gene expression was developed. This method consists of binding specific DNA oligonucleotide probes with mRNA, ligating DNA probes bound to mRNA by DNA ligase, and then amplifying the ligated DNA segments with qPCR. Buffered solutions with additives have been developed that allow hybridization, ligation and qPCR to be performed in a single tube. A kit for the determination of user selected mRNA has been designed. The kit contains all the necessary components for the quantification of gene expression from isolated RNA, including instructions for design of specific oligonucleotide primers, enzymes needed for ligation and amplification of ligated fragments by qPCR using hydrolysis probes. Oligonucleotide DNA probes specific for selected mRNAs, amplification DNA primers, and hydrolysis probes are not included in the kit.

Druh

G_prot - Prototyp

CEP obor

—

OECD FORD obor

30101 - Human genetics

Projekt

<a href="/cs/project/FV20479" target="_blank" >FV20479: Zjednodušená metoda kvantifikace exprese specifických genů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

R-qPCR-HYDROLYSIS PROBE

Číselná identifikace

—

Technické parametry

Jedná se o univerzální soupravu R-qPCR s využitím hydrolyzačních sond. Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix pro použití s hydrolyzační sondou a 3) DNA ligázu (SplintR). Souprava neobsahuje DNA sondy, amplifikační primery a hydrolyzační sondu, ale obsahuje návod na navržení optimálních DNA sond. Soupravu bude vyrábět Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, která se podílela na řešení projektu.

Ekonomické parametry

Univerzálních R-qPCR souprav s využitím hydrolyzační sondy se může ročně prodat až několik tisíc kusů ročně se ziskem z domácího trhu v jednotkách miliónů Kč.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

64578895

Název vlastníka

Top-Bio, s.r.o., Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

Z - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje v některých případech licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

—