Diagnostika pacientů s podezřením na Ph-negativní myeloproliferativní neoplázii

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F19%3A00071702" target="_blank" >RIV/65269705:_____/19:00071702 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://aleph.nkp.cz/F/?func=direct&doc_number=003124000&local_base=NKC" target="_blank" >https://aleph.nkp.cz/F/?func=direct&doc_number=003124000&local_base=NKC</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Diagnostika pacientů s podezřením na Ph-negativní myeloproliferativní neoplázii

Popis výsledku v původním jazyce

Mezi Ph-negativní myeloproliferativní neoplázie (MPN) patří polycytemie vera (PV), esenciální trombocytémie (ET) a primární myelofibróza (PMF). Důležitým diagnostickým a prognostickým znakem těchto onemocnění jsou mutace ve specifických regionech genů JAK2 (hlavně exon 14, sporadicky rovněž exon 12), CALR (exon 9) a MPL (exon 10). DNA 117 pacientů byla izolována ze separovaných granulocytů, případně z plné krve. Sangerovým sekvenováním byly analyzovány geny JAK2 (exon 14 a exon 12), CALR (exon 9) a MPL (exon 10) po předchozí amplifikaci pomocí PCR. Vyšetřováno bylo dle požadavků lékařů. Všechny 4 exony byly vyšetřeny u 51 pacientů, 3 exony u 8 pacientů, 2 exony u 43 pacientů a 1 exon u 15 pacientů. JAK2 (exon 12) a MPL byly vyšetřeny u 105 pacientů, MPL u 64 pacientů a JAK2 (exon 14) u 59 pacientů. Celkově bylo nalezeno 17 mutací u 17 pacientů (14,5 %). V genu JAK2 byla v exonu 14 nalezena u tohoto typu pacientů nejčastěji se vyskytující mutace p.Val617Phe u 13 pacientů (11,1 % pacientů; 22 % vyšetření). V genu MPL byla nalezena mutace p.Trp515Leu u 2 pacientů (1,7 % pacientů; 1,9 % vyšetření). A v genu CALR byla nalezena delece o rozsahu 52-bp označovaná jako typ 1 rovněž u 2 pacientů (1,7 % pacientů; 3,1 % vyšetření). S výjimkou 2 izolátů z plné krve byly všechny mutace zachyceny v DNA ze separovaných granulocytů. Ve všech sledovaných genech byly nalezeny mutace nejčastěji se vyskytující u pacientů s PV, ET a PMF. Ve všech případech se jednalo o kauzální mutace a byla tak jednoznačně stanovena diagnóza a bylo možné stanovit prognózu onemocnění. Záchyt mutací byl srovnatelný s údaji uváděnými v literatuře. Analyzovat je možné DNA z plné krve, byť v případě analýzy DNA ze separovaných granulocytů můžeme očekávat vyšší citlivost. Detekce nejčastějších mutací u suspektních Ph-negativních myeloproliferativních neoplázií je pro pacienty diagnosticky a prognosticky přínosná.

Název v anglickém jazyce

Diagnosis of patients with suspected Ph-negative myeloproliferative neoplasia

Popis výsledku anglicky

Ph-negative myeloproliferative neoplasias (MPNs) include polycythemia vera (PV), essential thrombocythemia (ET) and primary myelofibrosis (PMF). Mutations in specific regions of the JAK2 (mainly exon 14, sporadically also exon 12), CALR (exon 9) and MPL (exon 10) genes are important diagnostic and prognostic features of these diseases. DNA from 117 patients was isolated from separated granulocytes or whole blood. The JAK2 (exon 14 and exon 12), CALR (exon 9) and MPL (exon 10) genes were analyzed by sanger sequencing after previous PCR amplification. It was examined according to the requirements of doctors. All 4 exons were examined in 51 patients, 3 exons in 8 patients, 2 exons in 43 patients and 1 exon in 15 patients. JAK2 (exon 12) and MPL were examined in 105 patients, MPL in 64 patients and JAK2 (exon 14) in 59 patients. A total of 17 mutations were found in 17 patients (14.5%). In exon 14, the most common mutation p.Val617Phe was found in the JAK2 gene in exon 14 in 13 patients (11.1% of patients; 22% of examinations). A mutation in p.Trp515Leu was found in the MPL gene in 2 patients (1.7% of patients; 1.9% of examinations). And a deletion of the 52-bp range, referred to as type 1, was also found in the CALR gene in 2 patients (1.7% of patients; 3.1% of examinations). With the exception of 2 whole blood isolates, all mutations were captured in DNA from separated granulocytes. Mutations most frequently found in patients with PV, ET and PMF were found in all monitored genes. In all cases, these were causal mutations, so the diagnosis was clearly established and it was possible to determine the prognosis of the disease. Mutation detection was comparable to data reported in the literature. It is possible to analyze DNA from whole blood, although in the case of DNA analysis from separated granulocytes we can expect higher sensitivity. Detection of the most common mutations in suspected Ph-negative myeloproliferative neoplasms is diagnostically and prognostically beneficial for patients.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

<a href="/cs/project/TE02000058" target="_blank" >TE02000058: Centrum kompetence pro molekulární diagnostiku a personalizovanou medicínu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů