Increased expression of long non-coding RNA BTN2A3P contributes to the malignant glioblastoma phenotype

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F21%3A00074750" target="_blank" >RIV/65269705:_____/21:00074750 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/495.pdf" target="_blank" >https://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/495.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

slovinština

Název v původním jazyce

Zvýšená expresia dlhej nekódujúcej RNA BTN2A3P prispieva k malígnemu fenotypu glioblastomu

Popis výsledku v původním jazyce

Východiská: Dlhé nekódujúce RNA (lncRNA) sú významným regulátorom širokého spektra bunkových procesov. V zdravom tkanive vykazujú vysoko špecifické expresné profily. Dysregulácia lncRNA je predmetom štúdia u rady nádorov vrátane glioblastomu, ktorý je najčastejším primárnym malígnym nádorom mozgu. Podľa dát získaných z TCGA a nezávislej kohorty pacientov analyzovanej na našom pracovisku bola expresia BTN2A3P lncRNA v tkanivách glioblastomu zvýšená oproti normálnemu tkanivu. Funkcia tohoto transkriptu nebola zatiaľ popísaná. Materiál a metódy: Knockdown BTN2A3P lncRNA v bunečnej línii U251-MG bol docielený metódou CRISPR/Cas9 s využitím lentivírového represorového konštruktu dCas-KRAB v kombinácií s gRNA cieliacimi na pozície -22, +137 a +256 nt od miesta počiatku transkripcie. K tvorbe línií slúžiacich ako negatívna kontrola boli využité necieliace gRNA. Expresia BTN2A3P bola analyzovaná pomocou qRT-PCR (TaqMan Gene Expression Assay). Stabilita represie bola monitorovaná po dobu 16 pasáží. Línie boli podrobené panelu in vitro testov a analýze bunečného cyklu. Ortotopická xenotransplatácia do NOD scid gamma myší (n = 11) poslúžila k posúdeniu vplyvu miery expresie BTN2A3P na malígny fenotyp buniek in vivo. Výsledky: Expresia BTN2A3P sa vo vygenerovaných líniách líšila v závislosti na použitej gRNA. Pokles v efektivite represie so stúpajúcou pasážou poukazoval na možnú selekčnú výhodu klonov s vyššou hladinou BTN2A3P. U línie s najefektívnejšou represiou BTN2A3P (B3) bola pozorovaná nižšia schopnosť zakladať kolónie (p &lt; 0,05), oproti negatívnej kontrole. Analýza vzťahu medzi expresiou BTN2A3P a počtom kolónií odhalila pozitívnu koreláciu (p &lt; 0,05). Priemerná veľkosť nádorových ložisiek u myšieho ortotopického modelu sa medzi pokusnými skupinami nelíšila. V kontrolnej skupine došlo k rozvoju nádoru u všetkých myší, zatiaľ čo v skupine B3 tomu tak bolo len u 60 % jedincov. Pilotný experiment ukázal, že by sa BTN2A3P lncRNA mohla podieľať na regulácií expresie miR-34a-p5. Záver: Z našich experimentov vyplýva, že zvýšená expresia BTN2A3P sa podieľa na malignite glioblastomu in vitro. Výsledky pilotného experimentu na myšom ortotopickom modely naznačili, že zvýšená hladina BTN2A3P môže prispievať k schopnosti zakladať nádory in vivo. Molekulárny mechanizmus, prostredníctvom ktorého BTN2A3P reguluje génovú expresiu je v súčasnosti predmetom skúmania.

Název v anglickém jazyce

Increased expression of long non-coding RNA BTN2A3P contributes to the malignant glioblastoma phenotype

Popis výsledku anglicky

Background: Long non-coding RNAs (lncRNAs) are important regulators of a wide range of cellular processes. They show highly specific expression profiles in healthy tissue. LncRNA dysregulation has been studied in a number of tumors, including glioblastoma, which is the most common primary brain tumor. According to data obtained from TCGA and an independent cohort of patients analyzed at our site, the expression of BTN2A3P lncRNA in glioblastoma tissues was increased compared to normal tissue. The function of this transcript has not yet been described. Conclusion: Our experiments show that increased BTN2A3P expression is involved in glioblastoma malignancy in vitro. The results of a pilot experiment in a mouse orthotopic model suggested that elevated BTN2A3P levels may contribute to the ability to establish tumors in vivo. The molecular mechanism by which BTN2A3P regulates gene expression is currently under investigation.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

30212 - Surgery

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů